RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	KAT6A	Q92794	2004 aa		24.89	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	24.88	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAM17	P78536	824 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	MBTPS1	Q14703	1052 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	CEP55	Q53EZ4	464 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	24.88	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	24.88	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	MSRA	Q9UJ68	235 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	24.88	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	MEIS1	O00470	390 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	TREH	O43280	583 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	24.87	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	24.87	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	PTPRS	Q13332	1948 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	NFASC	O94856	1347 aa		24.86	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	BAIAP3	O94812	1187 aa		24.86	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	AR	P10275	920 aa		24.86	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	RABGGTB	P53611	331 aa		24.86	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	24.86	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	SETD4	Q9NVD3	440 aa		24.86	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		24.86	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	PPFIA3	O75145	1194 aa		24.86	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGAP4	P98171	946 aa		24.86	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	TCTN1	Q2MV58	587 aa		24.86	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		24.86	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		24.86	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	24.86	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	24.86	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		24.86	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	C6orf50	Q9HD87	102 aa		24.86	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP3A4	P08684	503 aa		24.85	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	MYOG	P15173	224 aa		24.85	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	24.85	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		24.85	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		24.85	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		24.85	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC9A7	Q96T83	725 aa		24.85	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	PCYT2	Q99447	389 aa		24.85	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		24.85	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	24.85	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		24.85	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	NRCAM	Q92823	1304 aa		24.84	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM86B1	E9PN63	330 aa		24.84	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		24.84	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	LGR5	O75473	907 aa		24.84	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	24.84	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		24.84	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	GNAT1	P11488	350 aa		24.84	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	THPO	P40225	353 aa		24.84	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		24.84	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	24.84	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	EMSY	Q7Z589	1322 aa		24.83	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		24.83	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	FOSL2	P15408	326 aa		24.83	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	GNA11	P29992	359 aa		24.83	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	24.83	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	MCTP2	Q6DN12	878 aa		24.83	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	24.83	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		24.83	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		24.83	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		24.83	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		24.83	■■□□□ 1.57
PPP4C-205	ENST00000563200	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		24.82	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	CAND2	O75155	1236 aa		24.82	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	RSPH10B	P0C881	870 aa		24.82	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	24.82	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	24.82	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	24.82	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	REV3L	O60673	3130 aa		24.81	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	ACTR2	P61160	394 aa		24.81	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		24.81	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	GLG1	Q92896	1179 aa		24.81	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	SDF4	Q9BRK5	362 aa		24.81	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		24.81	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		24.81	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	24.8	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	ATG7	O95352	703 aa		24.8	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	ANAPC15	P60006	121 aa		24.8	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	24.8	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		24.8	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		24.8	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	IL17RA	Q96F46	866 aa		24.8	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		24.8	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		24.79	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	MARK3	P27448	753 aa		24.79	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF76	P36508	570 aa		24.79	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	PPFIA1	Q13136	1202 aa		24.79	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		24.79	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	RPAIN	Q86UA6	219 aa		24.79	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	BICD2	Q8TD16	824 aa		24.79	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		24.79	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		24.79	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	24.78	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	EDIL3	O43854	480 aa		24.78	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	CCNE2	O96020	404 aa		24.78	■■□□□ 1.56
PPP4C-205	ENST00000563200	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		24.78	■■□□□ 1.56

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms