RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 TGFB1P01137 390 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 PROCP04070 461 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 PDE6AP16499 860 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 SESN3P58005 492 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 CHRNEQ04844 493 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 HHIPL2Q6UWX4 724 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 RELTQ969Z4 430 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 CCDC120Q96HB5 630 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 JMJD8Q96S16 334 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 SPTLC3Q9NUV7 552 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 OXSMQ9NWU1 459 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM59LQ9UK28 342 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 TAF6LQ9Y6J9 622 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 C22orf46C9J442 243 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 PRKD3O94806 890 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 ZGLP1P0C6A0 271 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.78□□□□□ -1.162e-6■■□□□ 11.4
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TMOD3-208ENST00000560725 PPP2R5AQ15172 486 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF174Q15697 407 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 FIGNQ5HY92 759 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 CREB3L3Q68CJ9 461 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 OTOP3Q7RTS5 596 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 ZBTB46Q86UZ6 589 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 PASD1Q8IV76 773 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 LZTR1Q8N653 840 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 SLC5A5Q92911 643 aa7.78□□□□□ -1.16
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TMOD3-208ENST00000560725 JAM3Q9BX67 310 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 TRIM8Q9BZR9 551 aa7.78□□□□□ -1.16
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TMOD3-208ENST00000560725 SLC5A6Q9Y289 635 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 NUB1Q9Y5A7 615 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 CCNB3Q8WWL7 1395 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 ABCC1P33527 1531 aa7.78□□□□□ -1.16
TMOD3-208ENST00000560725 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
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TMOD3-208ENST00000560725 MTUS2Q5JR59 1369 aa7.77□□□□□ -1.17
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TMOD3-208ENST00000560725 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
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TMOD3-208ENST00000560725 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
TMOD3-208ENST00000560725 MTA3Q9BTC8 594 aa7.77□□□□□ -1.17
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TMOD3-208ENST00000560725 A0A1W2PQ64 194 aa7.76□□□□□ -1.17
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TMOD3-208ENST00000560725 TSPAN6O43657 245 aa7.76□□□□□ -1.17
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TMOD3-208ENST00000560725 JAM2P57087 298 aa7.76□□□□□ -1.17
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TMOD3-208ENST00000560725 ASIC4Q96FT7 647 aa7.76□□□□□ -1.17
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TMOD3-208ENST00000560725 YIPF4Q9BSR8 244 aa7.76□□□□□ -1.17
TMOD3-208ENST00000560725 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
TMOD3-208ENST00000560725 PCIF1Q9H4Z3 704 aa7.76□□□□□ -1.17
TMOD3-208ENST00000560725 SRPK3Q9UPE1 567 aa7.76□□□□□ -1.17
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TMOD3-208ENST00000560725 NPATQ14207 1427 aa7.76□□□□□ -1.17
TMOD3-208ENST00000560725 PREX1Q8TCU6 1659 aa7.76□□□□□ -1.17
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