RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555617.5

ABCD4-222, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-222	ENST00000555617	STPG1	Q5TH74	334 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	SH2D4A	Q9H788	454 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	RNF146	Q9NTX7	359 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	SERINC5	Q86VE9	423 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	SPATA18	Q8TC71	538 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	KIFC2	Q96AC6	838 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	KLK13	Q9UKR3	277 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	PSEN2	P49810	448 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	PPP2R5B	Q15173	497 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	C7orf31	Q8N865	590 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	RAD50	Q92878	1312 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	FSD2	A1L4K1	749 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617		J3QKU1	62 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	HAS3	O00219	553 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	ZBED4	O75132	1171 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF605	Q86T29	641 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	CASP10	Q92851	521 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	MYH4	Q9Y623	1939 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	ENPP3	O14638	875 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	APAF1	O14727	1248 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	FGF18	O76093	207 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF286B	P0CG31	522 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	PDE4B	Q07343	736 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	RAB23	Q9ULC3	237 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ABCD4-222	ENST00000555617	VAMP4	O75379	141 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	NDUFB10	O96000	172 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	SRF	P11831	508 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	STARD6	P59095	220 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	MFSD10	Q14728	455 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF843	Q8N446	348 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	MYL10	Q9BUA6	226 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	13.64	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	GOPC	Q9HD26	462 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	CACNA1E	Q15878	2313 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	LAMA4	Q16363	1823 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	NOTCH2	Q04721	2471 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	CYP7A1	P22680	504 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	UBE3A	Q05086	875 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	ARHGAP1	Q07960	439 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	TFCP2	Q12800	502 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	TCF25	Q9BQ70	676 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	BCO2	Q9BYV7	579 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	USP44	Q9H0E7	712 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	OAZ1	P54368	228 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC39A7	Q92504	469 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	APBB2	Q92870	758 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	CLMP	Q9H6B4	373 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM260	Q9NX78	707 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	FBXO3	Q9UK99	471 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	FBN2	P35556	2912 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	HR	O43593	1189 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ABCD4-222	ENST00000555617	F2	P00734	622 aa		13.61	□□□□□ -0.23

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