RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551206.5

USP15-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 1,022 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-217ENST00000551206 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 GJB4Q9NTQ9 266 aa14.85□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 PCDHA4Q9UN74 947 aa14.85□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa14.85□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 CYP3A4P08684 503 aa14.84□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 HIC1Q14526 733 aa14.84□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 PRR16Q569H4 304 aa14.84□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 ZNF365Q70YC5 407 aa14.84□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 BLIDQ8IZY5 108 aa14.84□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.84□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 GLG1Q92896 1179 aa14.84□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 GTF3C6Q969F1 213 aa14.84□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 CTAGE1Q96RT6 745 aa14.84□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 KIF2CQ99661 725 aa14.84□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 SLC9A2Q9UBY0 812 aa14.84□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 LTBP2Q14767 1821 aa14.84□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 IQCF3P0C7M6 154 aa14.83□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa14.83□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa14.83□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 MARK3P27448 753 aa14.83□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 BFSP2Q13515 415 aa14.83□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 TMEM240Q5SV17 173 aa14.83□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 NIPA1Q7RTP0 329 aa14.83□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 DEFB128Q7Z7B8 93 aa14.83□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 RNPEPQ9H4A4 650 aa14.83□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 IL23AQ9NPF7 189 aa14.83□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 SETD4Q9NVD3 440 aa14.83□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.83□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa14.82□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 C17orf102A2RUQ5 167 aa14.82□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 JAK2O60674 1132 aa14.82□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 FGBP02675 491 aa14.82□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 FDPSP14324 419 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 XBP1P17861 261 aa14.82□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 FOSBP53539 338 aa14.82□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 ACTR2P61160 394 aa14.82□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 GALNT17Q6IS24 598 aa14.82□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 OTOP2Q7RTS6 562 aa14.82□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 TBCKQ8TEA7 893 aa14.82□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.82□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 ZNF577Q9BSK1 485 aa14.82□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 STK36Q9NRP7 1315 aa14.82□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 DOCK5Q9H7D0 1870 aa14.81□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.81□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 EDIL3O43854 480 aa14.81□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 RBM25P49756 843 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 USP11P51784 963 aa14.81□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 NPY5RQ15761 445 aa14.81□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.81□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 WASF1Q92558 559 aa14.81□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 WNT8BQ93098 351 aa14.81□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.81□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa14.81□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 AZI2Q9H6S1 392 aa14.81□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 ERAP1Q9NZ08 941 aa14.81□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 NFASCO94856 1347 aa14.81□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 LAMA3Q16787 3333 aa14.8□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 M0R2N6 131 aa14.8□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 DHX15O43143 795 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 TREHO43280 583 aa14.8□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 CCNE2O96020 404 aa14.8□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 GNAT1P11488 350 aa14.8□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 CKBP12277 381 aa14.8□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 CIITAP33076 1130 aa14.8□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 THPOP40225 353 aa14.8□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 PTK7Q13308 1070 aa14.8□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 CCDC83Q8IWF9 413 aa14.8□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 DAGLBQ8NCG7 672 aa14.8□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 CAGE1Q8TC20 777 aa14.8□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 OXER1Q8TDS5 423 aa14.8□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 VWCEQ96DN2 955 aa14.8□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 PCYT2Q99447 389 aa14.8□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa14.79□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 BACH1O14867 736 aa14.79□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 SLC34A2O95436 690 aa14.79□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 SELPP16109 830 aa14.79□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 STAT5BP51692 787 aa14.79□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 IGBP1P78318 339 aa14.79□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 SETQ01105 290 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 ST3GAL1Q11201 340 aa14.79□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 PPFIA1Q13136 1202 aa14.79□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.79□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 INF2Q27J81 1249 aa14.79□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 Q7L0L9 218 aa14.79□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 LRRC8DQ7L1W4 858 aa14.79□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 KRT25Q7Z3Z0 450 aa14.79□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 SERINC5Q86VE9 423 aa14.79□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.1 ms