RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545368.5

CDCA3-210, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 3

Gene CDCA3, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-210ENST00000545368 PSAPP07602 524 aa14.63□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 PTGS1P23219 599 aa14.63□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 LONP1P36776 959 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 ME1P48163 572 aa14.63□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 GJA9P57773 515 aa14.63□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 ACTR2P61160 394 aa14.63□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 HSDL1Q3SXM5 330 aa14.63□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa14.63□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 RDM1Q8NG50 284 aa14.63□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 AFG1LQ8WV93 481 aa14.63□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 SEPT1Q8WYJ6 367 aa14.63□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 GPR20Q99678 358 aa14.63□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.63□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 RCOR1Q9UKL0 485 aa14.63□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 POTEMA6NI47 508 aa14.62□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 CUTAO60888 179 aa14.62□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 CCNE2O96020 404 aa14.62□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 PGK1P00558 417 aa14.62□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 MMP3P08254 477 aa14.62□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.62□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 PDIA5Q14554 519 aa14.62□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 DGKDQ16760 1214 aa14.62□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.62□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 B3GNT9Q6UX72 402 aa14.62□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 RNF180Q86T96 592 aa14.62□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 IGSF22Q8N9C0 903 aa14.62□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 AK8Q96MA6 479 aa14.62□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 DEFB118Q96PH6 123 aa14.62□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 GDPD2Q9HCC8 539 aa14.62□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 DISC1Q9NRI5 854 aa14.62□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 LRWD1Q9UFC0 647 aa14.62□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa14.62□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 A6NJR5 290 aa14.61□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 BACH1O14867 736 aa14.61□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 ADAMTS4O75173 837 aa14.61□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa14.61□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 CST5P28325 142 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 TXLNAP40222 546 aa14.61□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 EPHA7Q15375 998 aa14.61□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 IL17AQ16552 155 aa14.61□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 FAM160B1Q5W0V3 765 aa14.61□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 LHX8Q68G74 356 aa14.61□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 ARRDC4Q8NCT1 418 aa14.61□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 NEK9Q8TD19 979 aa14.61□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.61□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 CSRNP2Q9H175 543 aa14.61□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 AZI2Q9H6S1 392 aa14.61□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa14.6□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa14.6□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 EML1O00423 815 aa14.6□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 KPNA6O60684 536 aa14.6□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 PPFIA4O75335 1185 aa14.6□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 ATG7O95352 703 aa14.6□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 GJB1P08034 283 aa14.6□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 NKX3-2P78367 333 aa14.6□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 BEX3Q00994 111 aa14.6□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 GRIN1Q05586 938 aa14.6□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 GNASQ5JWF2 1037 aa14.6□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 KRT79Q5XKE5 535 aa14.6□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 ABHD15Q6UXT9 468 aa14.6□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 CLEC17AQ6ZS10 378 aa14.6□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 SNX29Q8TEQ0 813 aa14.6□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.6□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 ZNF302Q9NR11 478 aa14.6□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 PCDHA7Q9UN72 937 aa14.6□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 EMSYQ7Z589 1322 aa14.6□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa14.6□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 HTTP42858 3142 aa14.59□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 MYADML2A6NDP7 307 aa14.59□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 KBTBD13C9JR72 458 aa14.59□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 GOLGA6L22H0YM25 854 aa14.59□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 LGALS2P05162 132 aa14.59□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 P4HBP07237 508 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 MYL3P08590 195 aa14.59□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 CAPN2P17655 700 aa14.59□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 UBA7P41226 1012 aa14.59□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 LRRC41Q15345 812 aa14.59□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 RASSF8Q8NHQ8 419 aa14.59□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 GLG1Q92896 1179 aa14.59□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 CLIC6Q96NY7 704 aa14.59□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa14.59□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 GABBR1Q9UBS5 961 aa14.59□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 WDR81Q562E7 1941 aa14.58□□□□□ -0.07
CDCA3-210ENST00000545368 POTEFA5A3E0 1075 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms