RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 SUGCTQ9HAC7 445 aa21.43■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 hCG_1984214I3L0E3 225 aa21.42■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 FUT2Q10981 343 aa21.42■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 PPP1R18Q6NYC8 613 aa21.42■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa21.42■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 SEPT8Q92599 483 aa21.42■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 CERS4Q9HA82 394 aa21.42■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 SETD4Q9NVD3 440 aa21.42■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 APOA5Q6Q788 366 aa21.41■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 SPRED2Q7Z698 418 aa21.41■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 IL27Q8NEV9 243 aa21.41■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 SEPT1Q8WYJ6 367 aa21.41■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 HLA-CQ95604 372 aa21.41■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 EHMT1Q9H9B1 1298 aa21.41■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 JADE2Q9NQC1 790 aa21.41■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 MYO7AQ13402 2215 aa21.41■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa21.4■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 SPDYE3A6NKU9 549 aa21.4■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 SORBS3O60504 671 aa21.4■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 ATP9AO75110 1047 aa21.4■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 TFF2Q03403 129 aa21.4■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 MTMR1Q13613 665 aa21.4■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 TRIM50Q86XT4 487 aa21.4■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.4■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 ERAP1Q9NZ08 941 aa21.4■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 SQORQ9Y6N5 450 aa21.4■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa21.39■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 FOSP01100 380 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 KRT40Q6A162 431 aa21.39■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 NEK1Q96PY6 1258 aa21.39■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 GLT8D2Q9H1C3 349 aa21.39■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa21.39■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.39■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 WDR81Q562E7 1941 aa21.39■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 NFASCO94856 1347 aa21.38■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 MICALL1Q8N3F8 863 aa21.38■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 RIC8AQ9NPQ8 531 aa21.38■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 PCDHA6Q9UN73 950 aa21.38■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 TELO2Q9Y4R8 837 aa21.38■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa21.38■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 CHRNA1P02708 482 aa21.37■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 RXRAP19793 462 aa21.37■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 MGAT3Q09327 533 aa21.37■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.37■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 FBXL16Q8N461 479 aa21.37■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 KCNH7Q9NS40 1196 aa21.37■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa21.37■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 RRN3P2A6NIE6 340 aa21.36■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 KCNQ1P51787 676 aa21.36■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 ARHGAP4P98171 946 aa21.36■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 KRT32Q14532 448 aa21.36■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 COL19A1Q14993 1142 aa21.36■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 MARCH8Q5T0T0 291 aa21.36■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 MICU3Q86XE3 530 aa21.36■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 MYOCDQ8IZQ8 938 aa21.36■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 GDPD5Q8WTR4 605 aa21.36■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 KCNB2Q92953 911 aa21.36■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 MXRA8Q9BRK3 442 aa21.36■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 OSBPL7Q9BZF2 842 aa21.36■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 H3BNC9 293 aa21.35■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 ATG7O95352 703 aa21.35■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 PPFIA1Q13136 1202 aa21.35■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 AP3B2Q13367 1082 aa21.35■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 UBE2SQ16763 222 aa21.35■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.35■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 TYW1BQ6NUM6 668 aa21.35■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 NIPA1Q7RTP0 329 aa21.35■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa21.35■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 RSPH3Q86UC2 560 aa21.35■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 FBXO22Q8NEZ5 403 aa21.35■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 TUBE1Q9UJT0 475 aa21.35■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 NID2Q14112 1375 aa21.35■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 EVPLQ92817 2033 aa21.34■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 C5orf67F2Z3F1 127 aa21.34■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 MEIS1O00470 390 aa21.34■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 SREBF1P36956 1147 aa21.34■■□□□ 1.01
LTBR-211ENST00000543190 CLK2P49760 499 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
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