RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, human

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMO3-222	ENST00000540445	SLC9A7	Q96T83	725 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	JADE2	Q9NQC1	790 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	SETD4	Q9NVD3	440 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	STXBP3	O00186	592 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	TREH	O43280	583 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	NBN	O60934	754 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	BAIAP3	O94812	1187 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	ARHGEF15	O94989	841 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	RSPH10B	P0C881	870 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	RPS6KB1	P23443	525 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	RCAN1	P53805	252 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	ARHGAP4	P98171	946 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	FUT2	Q10981	343 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	IKBKE	Q14164	716 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	TCTN1	Q2MV58	587 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	TRIM50	Q86XT4	487 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	SDF4	Q9BRK5	362 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	BARHL2	Q9NY43	387 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	MUC3A	Q02505	3323 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	TLL1	O43897	1013 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	PPFIA3	O75145	1194 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	CA3	P07451	260 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	SCG2	P13521	617 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	KCNA2	P16389	499 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	MARK3	P27448	753 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	MBTPS1	Q14703	1052 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	RUFY3	Q7L099	469 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	SERINC5	Q86VE9	423 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	ANO3	Q9BYT9	981 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	CERS4	Q9HA82	394 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	C6orf50	Q9HD87	102 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	TMEM260	Q9NX78	707 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	EMSY	Q7Z589	1322 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	TTC28	Q96AY4	2481 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	LGR5	O75473	907 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	CTSH	P09668	335 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	AR	P10275	920 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	GNA11	P29992	359 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	TAP1	Q03518	808 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	AP3B2	Q13367	1082 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	CEP55	Q53EZ4	464 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	PHKB	Q93100	1093 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	AZI2	Q9H6S1	392 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	NCOR1	O75376	2440 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	NRCAM	Q92823	1304 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LMO3-222	ENST00000540445	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	EPOP	A6NHQ4	379 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	EFCAB14	O75071	495 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	IGBP1	P78318	339 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	ADAM17	P78536	824 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	DEFB103A	P81534	67 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	PPFIA1	Q13136	1202 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LMO3-222	ENST00000540445	FBXL16	Q8N461	479 aa		10.27	□□□□□ -0.77

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