RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534198.1

RBM4B-208, Transcript of RNA binding motif protein 4B, human

TSL 3

Gene RBM4B, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM4B-208	ENST00000534198	COL4A6	Q14031	1691 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	POLR2M	P0CAP2	368 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	CTNNB1	P35222	781 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	PIGS	Q96S52	555 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	IL25	Q9H293	177 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	IGFLR1	Q9H665	355 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	SENP2	Q9HC62	589 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	TRIO	O75962	3097 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	C5orf42	Q9H799	3197 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	TECTA	O75443	2155 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	STXBP3	O00186	592 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	ATP9A	O75110	1047 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	MMP1	P03956	469 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	ITGB1	P05556	798 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	GHR	P10912	638 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	GNAT1	P11488	350 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	CCND2	P30279	289 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	NEDD9	Q14511	834 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	PLVAP	Q9BX97	442 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	CD207	Q9UJ71	328 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	SI	P14410	1827 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	NRCAM	Q92823	1304 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	USP34	Q70CQ2	3546 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	TMEM221	A6NGB7	291 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198		M0R296	226 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	GLP2R	O95838	553 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	ZXDA	P98168	799 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	ARHGAP4	P98171	946 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	TROAP	Q12815	778 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	COASY	Q13057	564 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	GRM4	Q14833	912 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	P2RX5	Q93086	422 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	RILPL2	Q969X0	211 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	MEIS2	O14770	477 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	FIBP	O43427	364 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	STAM2	O75886	525 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	EFHB	Q8N7U6	833 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	ASIC4	Q96FT7	647 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	PCYT2	Q99447	389 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	KRT23	Q9C075	422 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	LNPK	Q9C0E8	428 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	KCNA2	P16389	499 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	PTPN5	P54829	565 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	KCNC3	Q14003	757 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	HOMER1	Q86YM7	354 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	SMC5	Q8IY18	1101 aa		10.04	□□□□□ -0.8

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