RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534143.5

CMTM1-220, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 781 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-220ENST00000534143 BRD1O95696 1058 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 BMP3P12645 472 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 PDCP20941 246 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 ALAS2P22557 587 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 SLC1A4P43007 532 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 NUCB2P80303 420 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 PPATQ06203 517 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 PKP1Q13835 747 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 CCDC96Q2M329 555 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 KCTD1Q719H9 257 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 ERO1BQ86YB8 467 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 FAM184AQ8NB25 1140 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 STK32AQ8WU08 396 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 LPAR1Q92633 364 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 PBXIP1Q96AQ6 731 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 SHISA4Q96DD7 197 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 PRIMPOLQ96LW4 560 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 AIFM3Q96NN9 605 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 ALG1Q9BT22 464 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 CPVLQ9H3G5 476 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 ELP3Q9H9T3 547 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 KLK14Q9P0G3 267 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 MTMR6Q9Y217 621 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 KIF3AQ9Y496 699 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 CSADQ9Y600 493 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 THSD7BQ9C0I4 1608 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 LOC285556D6RIA3 1793 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 TMEM232C9JQI7 657 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 CXCL11O14625 94 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 GNB5O14775 395 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 WDR46O15213 610 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 STX6O43752 255 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 SCG2P13521 617 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 SLC16A2P36021 539 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 USP14P54578 494 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 PPIL2Q13356 520 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 DGKZQ13574 1117 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 OCLNQ16625 522 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 C11orf91Q3C1V1 193 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 FAM83BQ5T0W9 1011 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 FAM160B2Q86V87 743 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 ADGRF4Q8IZF3 695 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 SPICE1Q8N0Z3 855 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 C2orf69Q8N8R5 385 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 CHURC1Q8WUH1 139 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 WASF1Q92558 559 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 PIGSQ96S52 555 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 FEZ1Q99689 392 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 SUV39H2Q9H5I1 410 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 ZNF408Q9H9D4 720 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 JMJD4Q9H9V9 463 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 EFCC1Q9HA90 598 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 VAT1LQ9HCJ6 419 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 GJB4Q9NTQ9 266 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 FEM1BQ9UK73 627 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 SMCHD1A6NHR9 2005 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 TCHHQ07283 1943 aa7.05□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa7.05□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 TRIM75PA6NK02 468 aa7.05□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 RRP9O43818 475 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 PRMT3O60678 531 aa7.05□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 IGHA1P01876 353 aa7.05□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 VCAM1P19320 739 aa7.05□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 COL8A1P27658 744 aa7.05□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 STAT2P52630 851 aa7.05□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 HMGCS2P54868 508 aa7.05□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 MOGSQ13724 837 aa7.05□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 NPY5RQ15761 445 aa7.05□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 TMEM164Q5U3C3 297 aa7.05□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 SYDE2Q5VT97 1194 aa7.05□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 KRT40Q6A162 431 aa7.05□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa7.05□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 BHMTQ93088 406 aa7.05□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 OPTNQ96CV9 577 aa7.05□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 C8orf76Q96K31 380 aa7.05□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 GSX2Q9BZM3 304 aa7.05□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 SH3GLB2Q9NR46 395 aa7.05□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 FBXO28Q9NVF7 368 aa7.05□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.05□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 TMEM88BA6NKF7 163 aa7.04□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 STXBP3O00186 592 aa7.04□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 ZBTB5O15062 677 aa7.04□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 MICAL2O94851 1124 aa7.04□□□□□ -1.28
CMTM1-220ENST00000534143 F13A1P00488 732 aa7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms