RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532743.5

RAD51-208, Transcript of RAD51 recombinase, human

TSL 2 BASIC

Gene RAD51, Length 1,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD51-208	ENST00000532743	SLC37A4	O43826	429 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RAD51-208	ENST00000532743	ACTR2	P61160	394 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RAD51-208	ENST00000532743	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RAD51-208	ENST00000532743	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RAD51-208	ENST00000532743	TRIM50	Q86XT4	487 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RAD51-208	ENST00000532743	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RAD51-208	ENST00000532743	KAT2B	Q92831	832 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RAD51-208	ENST00000532743	TOX2	Q96NM4	488 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RAD51-208	ENST00000532743	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
RAD51-208	ENST00000532743	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
RAD51-208	ENST00000532743	MARCH6	O60337	910 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	CLTB	P09497	229 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	ATP2B1	P20020	1258 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	CDK7	P50613	346 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	KRT76	Q01546	638 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	C7orf31	Q8N865	590 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	GLG1	Q92896	1179 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	MBOAT7	Q96N66	472 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	PDC	P20941	246 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	AZI2	Q9H6S1	392 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	SAMM50	Q9Y512	469 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	SYN1	P17600	705 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	SLC5A5	Q92911	643 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	RIT2	Q99578	217 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	NOD1	Q9Y239	953 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	KIF28P	B7ZC32	967 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743		H0YGN5	161 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	POTED	Q86YR6	584 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	GJA10	Q969M2	543 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	EMSY	Q7Z589	1322 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	EVPL	Q92817	2033 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	BACH1	O14867	736 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	CHMP2A	O43633	222 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	CCNE2	O96020	404 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	HAS3	O00219	553 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	B4GALT4	O60513	344 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	NEMF	O60524	1076 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	27.78	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	FAAP100	Q0VG06	881 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	MARK3	P27448	753 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	FAM20A	Q96MK3	541 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	WDR64	B1ANS9	1081 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	MCM7	P33993	719 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	CALCRL	Q16602	461 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RAD51-208	ENST00000532743	TBX3	O15119	743 aa		27.76	■■■□□ 2.03
RAD51-208	ENST00000532743	STAT5B	P51692	787 aa		27.76	■■■□□ 2.03
RAD51-208	ENST00000532743	SESTD1	Q86VW0	696 aa		27.76	■■■□□ 2.03
RAD51-208	ENST00000532743	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		27.76	■■■□□ 2.03
RAD51-208	ENST00000532743	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		27.76	■■■□□ 2.03
RAD51-208	ENST00000532743	SCN5A	Q14524	2016 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RAD51-208	ENST00000532743	LGR5	O75473	907 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RAD51-208	ENST00000532743	PSMD10	O75832	226 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RAD51-208	ENST00000532743	CD4	P01730	458 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RAD51-208	ENST00000532743	PSAP	P07602	524 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RAD51-208	ENST00000532743	SFN	P31947	248 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RAD51-208	ENST00000532743	TRAPPC10	P48553	1259 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RAD51-208	ENST00000532743	JAK3	P52333	1124 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RAD51-208	ENST00000532743	PTGIS	Q16647	500 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RAD51-208	ENST00000532743	TTC38	Q5R3I4	469 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RAD51-208	ENST00000532743	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
RAD51-208	ENST00000532743	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RAD51-208	ENST00000532743	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RAD51-208	ENST00000532743	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RAD51-208	ENST00000532743	ZNF302	Q9NR11	478 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RAD51-208	ENST00000532743	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RAD51-208	ENST00000532743	WNT7A	O00755	349 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RAD51-208	ENST00000532743	ATG7	O95352	703 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RAD51-208	ENST00000532743	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RAD51-208	ENST00000532743	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RAD51-208	ENST00000532743	RAG1	P15918	1043 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RAD51-208	ENST00000532743	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
RAD51-208	ENST00000532743	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
RAD51-208	ENST00000532743	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03

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