RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 RUFY4Q6ZNE9 571 aa27.64■■■□□ 2.02
PTPRJ-205ENST00000527952 YME1L1Q96TA2 773 aa27.64■■■□□ 2.02
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC27A2O14975 620 aa27.63■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 MARK3P27448 753 aa27.63■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP27.63■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 TOP1MTQ969P6 601 aa27.63■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 SENP7Q9BQF6 1050 aa27.63■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 LZTS2Q9BRK4 669 aa27.63■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 PSTPIP2Q9H939 334 aa27.63■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 NLRC5Q86WI3 1866 aa27.62■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 ITGB5P18084 799 aa27.62■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 SMARCA1P28370 1054 aa27.62■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 EPC2Q52LR7 807 aa27.62■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa27.61■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 CAND2O75155 1236 aa27.61■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 CHRNA1P02708 482 aa27.61■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 KCNA2P16389 499 aa27.61■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 GNAQP50148 359 aa27.61■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 XRRA1Q6P2D8 792 aa27.61■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 ZBTB10Q96DT7 871 aa27.61■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 GHRP10912 638 aa27.6■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 KCNA5P22460 613 aa27.6■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 CREB3L3Q68CJ9 461 aa27.6■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 GPRASP2Q96D09 838 aa27.6■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM87BQ96K49 555 aa27.6■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 CD320Q9NPF0 282 aa27.6■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 PPFIA1Q13136 1202 aa27.59■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 GPM6BQ13491 265 aa27.59■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM26DQ5JW98 314 aa27.59■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 TMTC2Q8N394 836 aa27.59■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 SEPT1Q8WYJ6 367 aa27.59■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa27.59■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa27.59■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC12A7Q9Y666 1083 aa27.59■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 NRCAMQ92823 1304 aa27.59■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 MYO7AQ13402 2215 aa27.59■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa27.58■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 SKAP1Q86WV1 359 aa27.58■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 MICU3Q86XE3 530 aa27.58■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM192Q8IY95 271 aa27.58■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 MTA3Q9BTC8 594 aa27.58■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 PCDHA6Q9UN73 950 aa27.58■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa27.58■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa27.58■■■□□ 2.01
PTPRJ-205ENST00000527952 LIFRP42702 1097 aa27.57■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 IGBP1P78318 339 aa27.57■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 GRIK4Q16099 956 aa27.57■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 TMTC3Q6ZXV5 915 aa27.57■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 DNAJB3Q8WWF6 145 aa27.57■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 GLG1Q92896 1179 aa27.57■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 ANO2Q9NQ90 1003 aa27.57■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 SPDYE3A6NKU9 549 aa27.56■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 CALM1P0DP23 149 aa27.56■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 CALM2P0DP24 149 aa27.56■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 CALM3P0DP25 149 aa27.56■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 MTMR1Q13613 665 aa27.56■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 FANCBQ8NB91 859 aa27.56■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 APBB2Q92870 758 aa27.56■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 PGBD1Q96JS3 809 aa27.56■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 H3BNC9 293 aa27.55■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 IL9P15248 144 aa27.55■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 MGAT3Q09327 533 aa27.55■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 LPIN1Q14693 890 aa27.55■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 NECTIN1Q15223 517 aa27.55■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 PTPROQ16827 1216 aa27.55■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 EP400NLQ6ZTU2 488 aa27.55■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 CDHR1Q96JP9 859 aa27.55■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 TCEANC2Q96MN5 208 aa27.55■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 SAMD11Q96NU1 681 aa27.55■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 LRFN3Q9BTN0 628 aa27.55■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 TUBE1Q9UJT0 475 aa27.55■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM86C2PA6NEL3 165 aa27.54■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 H3BQ06 376 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 LEXMQ3ZCV2 418 aa27.54■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 TCEAL5Q5H9L2 206 aa27.54■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 MARCH8Q5T0T0 291 aa27.54■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 CYP2W1Q8TAV3 490 aa27.54■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 IL17RAQ96F46 866 aa27.54■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 EHMT1Q9H9B1 1298 aa27.54■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 JADE2Q9NQC1 790 aa27.54■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 ERAP1Q9NZ08 941 aa27.54■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 CSPG5O95196 566 aa27.53■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 TAF2Q6P1X5 1199 aa27.53■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 FIBCD1Q8N539 461 aa27.53■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 BANK1Q8NDB2 785 aa27.53■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 PCYT2Q99447 389 aa27.53■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 CDY2AQ9Y6F7 541 aa27.53■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa27.53■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa27.53■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa27.53■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 ENPP3O14638 875 aa27.52■■■□□ 2
PTPRJ-205ENST00000527952 CTNNB1P35222 781 aa27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms