RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522638.1

IGKV3D-34-201, Transcript of immunoglobulin kappa variable 3D-34 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGKV3D-34, Length 302 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ALDH1L2Q3SY69 923 aa7.01□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 C1orf210Q8IVY1 113 aa7.01□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 DNERQ8NFT8 737 aa7.01□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 FEZF2Q8TBJ5 459 aa7.01□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CHURC1Q8WUH1 139 aa7.01□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ADAM7Q9H2U9 754 aa7.01□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 EHMT1Q9H9B1 1298 aa7.01□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 USTQ9Y2C2 406 aa7.01□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 LAMA1P25391 3075 aa7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PTPDC1A2A3K4 754 aa7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 TAF4O00268 1085 aa7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 NARSO43776 548 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 LILRB5O75023 590 aa7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 TTLL1O95922 423 aa7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 EOMESO95936 686 aa7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CHGBP05060 677 aa7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 GLULP15104 373 aa7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CALML3P27482 149 aa7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 MTHFRP42898 656 aa7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 RPS6P62753 249 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ITIH3Q06033 890 aa7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 MGAT3Q09327 533 aa7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ZNF528Q3MIS6 628 aa7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 KIAA1841Q6NSI8 718 aa7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 LLGL2Q6P1M3 1020 aa7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 LRSAM1Q6UWE0 723 aa7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CHST3Q7LGC8 479 aa7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 AMOTL1Q8IY63 956 aa7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PLCD3Q8N3E9 789 aa7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PPTC7Q8NI37 304 aa7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 NETO1Q8TDF5 533 aa7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ATP6V0A1Q93050 837 aa7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 C16orf70Q9BSU1 422 aa7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 EPC1Q9H2F5 836 aa7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 C17orf102A2RUQ5 167 aa6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 HIDE1A8MVS5 230 aa6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CHRNA1P02708 482 aa6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 DCNP07585 359 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 WEE2P0C1S8 567 aa6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 C1QTNF9P0C862 333 aa6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ADD2P35612 726 aa6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 GATMP50440 423 aa6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ADAM17P78536 824 aa6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 LPIN1Q14693 890 aa6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SBK1Q52WX2 424 aa6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 KCTD1Q719H9 257 aa6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ZBTB44Q8NCP5 570 aa6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SSH3Q8TE77 659 aa6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 NELL1Q92832 810 aa6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 BORCS6Q96GS4 357 aa6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 TBC1D17Q9HA65 648 aa6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CYP26B1Q9NR63 512 aa6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 AAASQ9NRG9 546 aa6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SMC4Q9NTJ3 1288 aa6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 WNT16Q9UBV4 365 aa6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 FBXL21Q9UKT6 434 aa6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 USP18Q9UMW8 372 aa6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.99□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.98□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PPFIA3O75145 1194 aa6.98□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 FGF18O76093 207 aa6.98□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa6.98□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa6.98□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 GHRP10912 638 aa6.98□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 MCCP23508 829 aa6.98□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SLC1A4P43007 532 aa6.98□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ATP8B2P98198 1209 aa6.98□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 RING1Q06587 406 aa6.98□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 APOBRQ0VD83 1088 aa6.98□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 IKQ13123 557 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.98□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SPECC1Q5M775 1068 aa6.98□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PLPP4Q5VZY2 271 aa6.98□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 RCSD1Q6JBY9 416 aa6.98□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa6.98□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CES5AQ6NT32 575 aa6.98□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.98□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SEPT14Q6ZU15 432 aa6.98□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.98□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.98□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CASP10Q92851 521 aa6.98□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CHMP4CQ96CF2 233 aa6.98□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
IGKV3D-34-201ENST00000522638 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms