RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	STIM2	Q9P246	746 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	LAMB2	P55268	1798 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		5.51	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF233	A6NK53	670 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746		A6NNZ2	444 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	USP17L5	A8MUK1	530 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	OPA1	O60313	960 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	MOCS3	O95396	460 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	NR3C2	P08235	984 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	UBA7	P41226	1012 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CCT5	P48643	541 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	GNAQ	P50148	359 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	KIF11	P52732	1056 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	EPHB4	P54760	987 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	MECOM	Q03112	1051 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	EHHADH	Q08426	723 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	SPA17	Q15506	151 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC96	Q2M329	555 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	VWA3B	Q502W6	1294 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	PDXDC1	Q6P996	788 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CABP7	Q86V35	215 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	DGKH	Q86XP1	1220 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC42	Q96M95	316 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	BARHL2	Q9NY43	387 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	RNF14	Q9UBS8	474 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	GGA2	Q9UJY4	613 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	NUP98	P52948	1817 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ITGB4	P16144	1822 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	USP17L3	A6NCW0	530 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	USP17L4	A6NCW7	530 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	MYMK	A6NI61	221 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	EBAG9	O00559	213 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	NCK2	O43639	380 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	CYTH3	O43739	400 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	EDIL3	O43854	480 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	TLR2	O60603	784 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	NOL4	O94818	638 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	FSBP	O95073	299 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	OR52Z1	P0C646	297 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	FCER1A	P12319	257 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	SMPD1	P17405	629 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	MAGEA1	P43355	309 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	EVA1C	P58658	441 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	GNGT1	P63211	74 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	ASIC1	P78348	528 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	APBA1	Q02410	837 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	USP4	Q13107	963 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-212	ENST00000515746	GRB10	Q13322	594 aa		5.49	□□□□□ -1.53

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