RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 CDH23Q9H251 3354 aa12.94□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 EYSQ5T1H1 3165 aa12.93□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 TNFRSF10AO00220 468 aa12.93□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 DTNBO60941 627 aa12.93□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 SELPP16109 830 aa12.93□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 NAPAP54920 295 aa12.93□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 MFSD10Q14728 455 aa12.93□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP12.93□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 KIAA0753Q2KHM9 967 aa12.93□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 PPP1R18Q6NYC8 613 aa12.93□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 LRRC8DQ7L1W4 858 aa12.93□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 SESTD1Q86VW0 696 aa12.93□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 PPTC7Q8NI37 304 aa12.93□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa12.93□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 CTAGE1Q96RT6 745 aa12.93□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 PDCD2LQ9BRP1 358 aa12.93□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 KATNAL1Q9BW62 490 aa12.93□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 GLT8D2Q9H1C3 349 aa12.93□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa12.93□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 STX6O43752 255 aa12.92□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 TLL1O43897 1013 aa12.92□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 BAIAP3O94812 1187 aa12.92□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 ARHGEF15O94989 841 aa12.92□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 SYT1P21579 422 aa12.92□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 GNA11P29992 359 aa12.92□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 NLRP5P59047 1200 aa12.92□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 NUCB2P80303 420 aa12.92□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 PGM5Q15124 567 aa12.92□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 WWC2Q6AWC2 1192 aa12.92□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 GALNT17Q6IS24 598 aa12.92□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 FCHSD1Q86WN1 690 aa12.92□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa12.92□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 ARNTL2Q8WYA1 636 aa12.92□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP12.92□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 SPATA33Q96N06 139 aa12.92□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 AIFM3Q96NN9 605 aa12.92□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 ZBED2Q9BTP6 218 aa12.92□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 BRMS1Q9HCU9 246 aa12.92□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 C6orf50Q9HD87 102 aa12.92□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 ESYT2A0FGR8 921 aa12.91□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 EPOPA6NHQ4 379 aa12.91□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 STXBP3O00186 592 aa12.91□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 RGS20O76081 388 aa12.91□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 GGPS1O95749 300 aa12.91□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 F2P00734 622 aa12.91□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 POLR2MP0CAP2 368 aa12.91□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 CKBP12277 381 aa12.91□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 WDR5P61964 334 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 GHRHRQ02643 423 aa12.91□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 TAP1Q03518 808 aa12.91□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 GPNMBQ14956 572 aa12.91□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 HSDL1Q3SXM5 330 aa12.91□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 KRT40Q6A162 431 aa12.91□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 KCNV1Q6PIU1 500 aa12.91□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 VSIG10LQ86VR7 867 aa12.91□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 TEX2Q8IWB9 1127 aa12.91□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 IL31RAQ8NI17 732 aa12.91□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 BICD2Q8TD16 824 aa12.91□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 VPS54Q9P1Q0 977 aa12.91□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 MTCH2Q9Y6C9 303 aa12.91□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa12.9□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 SMCO2A6NFE2 343 aa12.9□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 HAS3O00219 553 aa12.9□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 NBNO60934 754 aa12.9□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 PPFIA4O75335 1185 aa12.9□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 PARNO95453 639 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 CCND2P30279 289 aa12.9□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 FOSBP53539 338 aa12.9□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 DEFB103AP81534 67 aa12.9□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 TFF2Q03403 129 aa12.9□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 RBL2Q08999 1139 aa12.9□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 PTK7Q13308 1070 aa12.9□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 MYSM1Q5VVJ2 828 aa12.9□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 CNKSR3Q6P9H4 555 aa12.9□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 SAMD3Q8N6K7 520 aa12.9□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 PHF20Q9BVI0 1012 aa12.9□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 ZMYND12Q9H0C1 365 aa12.9□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 PSTPIP2Q9H939 334 aa12.9□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 MLXIPQ9HAP2 919 aa12.9□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 CHMP5Q9NZZ3 219 aa12.9□□□□□ -0.34
UBE2B-208ENST00000511807 LCHNA4D1U4 455 aa12.89□□□□□ -0.35
UBE2B-208ENST00000511807 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa12.89□□□□□ -0.35
UBE2B-208ENST00000511807 CXCL10P02778 98 aa12.89□□□□□ -0.35
UBE2B-208ENST00000511807 MMP1P03956 469 aa12.89□□□□□ -0.35
UBE2B-208ENST00000511807 DDIT3P35638 169 aa12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms