RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	DEUP1	Q05D60	604 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FBXO38-208	ENST00000504971	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
FBXO38-208	ENST00000504971	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
FBXO38-208	ENST00000504971	POSTN	Q15063	836 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FBXO38-208	ENST00000504971	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FBXO38-208	ENST00000504971	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
FBXO38-208	ENST00000504971	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FBXO38-208	ENST00000504971	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FBXO38-208	ENST00000504971	HOMER1	Q86YM7	354 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FBXO38-208	ENST00000504971	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FBXO38-208	ENST00000504971	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
FBXO38-208	ENST00000504971	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FBXO38-208	ENST00000504971	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FBXO38-208	ENST00000504971	NELL1	Q92832	810 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FBXO38-208	ENST00000504971	SNX21	Q969T3	373 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FBXO38-208	ENST00000504971	LRRC45	Q96CN5	670 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FBXO38-208	ENST00000504971	GMCL1	Q96IK5	515 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FBXO38-208	ENST00000504971	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FBXO38-208	ENST00000504971	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
FBXO38-208	ENST00000504971	SH3GL3	Q99963	347 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FBXO38-208	ENST00000504971	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FBXO38-208	ENST00000504971	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	7.53	□□□□□ -1.2
FBXO38-208	ENST00000504971	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FBXO38-208	ENST00000504971	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
FBXO38-208	ENST00000504971	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
FBXO38-208	ENST00000504971	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FBXO38-208	ENST00000504971	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FBXO38-208	ENST00000504971	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		7.52	□□□□□ -1.2
FBXO38-208	ENST00000504971	TMCC2	O75069	709 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	ZBED4	O75132	1171 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	FGFR2	P21802	821 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	YY1	P25490	414 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	HAL	P42357	657 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	TIMM10	P62072	90 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	PFKP	Q01813	784 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	MAP3K10	Q02779	954 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	PICALM	Q13492	652 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	PDIA5	Q14554	519 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	ATP2B3	Q16720	1220 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	SPATA1	Q5VX52	437 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	SRL	Q86TD4	932 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	BICD1	Q96G01	975 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	XAGE2	Q96GT9	111 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	INCENP	Q9NQS7	918 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	FANCL	Q9NW38	375 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	FBXO10	Q9UK96	956 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	TRIM17	Q9Y577	477 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	CASZ1	Q86V15	1759 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	KDM1A	O60341	852 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	KPNA6	O60684	536 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	STAMBP	O95630	424 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	EPB42	P16452	691 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	PML	P29590	882 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	ADD2	P35612	726 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	SOX11	P35716	441 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	ATP6V1E1	P36543	226 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	HTR3A	P46098	478 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	NLRP12	P59046	1061 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	GABRE	P78334	506 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	SERINC3	Q13530	473 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	NFIX	Q14938	502 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	ARHGEF6	Q15052	776 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	RABEP1	Q15276	862 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	PKN1	Q16512	942 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	DBN1	Q16643	649 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	C14orf80	Q86SX3	495 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	LPIN2	Q92539	896 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		7.51	□□□□□ -1.21

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