RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF286BP0CG31 522 aa15.13■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 CD44P16070 742 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 CAPN2P17655 700 aa15.13■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAPPC10P48553 1259 aa15.13■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 RILPL1Q5EBL4 403 aa15.13■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 LENG9Q96B70 501 aa15.13■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 STARD7Q9NQZ5 370 aa15.13■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 NFASCO94856 1347 aa15.13■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1W2PQY0 241 aa15.12■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 MOXD2PA6NHM9 499 aa15.12■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 A6NJR5 290 aa15.12■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 WNT7AO00755 349 aa15.12■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 EDIL3O43854 480 aa15.12■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 KPNA6O60684 536 aa15.12■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 CST5P28325 142 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 TXKP42681 527 aa15.12■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 ACTR2P61160 394 aa15.12■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM47CQ5HY64 1035 aa15.12■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 SLFN12Q8IYM2 578 aa15.12■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 KLHDC9Q8NEP7 349 aa15.12■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 GLG1Q92896 1179 aa15.12■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC5A5Q92911 643 aa15.12■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 LRCH3Q96II8 777 aa15.12■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 GPR20Q99678 358 aa15.12■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 AZI2Q9H6S1 392 aa15.12■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa15.12■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 PHF24Q9UPV7 400 aa15.12■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 CTAGE5O15320 804 aa15.11■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 EVI5O60447 810 aa15.11■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 OR52Z1P0C646 297 aa15.11■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 PSMC6P62333 389 aa15.11■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 KRT76Q01546 638 aa15.11■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 RESTQ13127 1097 aa15.11■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa15.11■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 ETNPPLQ8TBG4 499 aa15.11■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 SEPT1Q8WYJ6 367 aa15.11■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM20AQ96MK3 541 aa15.11■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 MBOAT7Q96N66 472 aa15.11■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 RIT2Q99578 217 aa15.11■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa15.11■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 ELP1O95163 1332 aa15.11■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 DOCK5Q9H7D0 1870 aa15.1■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 PPFIA4O75335 1185 aa15.1■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 CABYRO75952 493 aa15.1■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 PURAQ00577 322 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 PKP1Q13835 747 aa15.1■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM266Q2M3C6 531 aa15.1■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 NCAPH2Q6IBW4 605 aa15.1■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM173BQ6P4H8 233 aa15.1■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 MIER3Q7Z3K6 550 aa15.1■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 TRIM50Q86XT4 487 aa15.1■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 CKAP2LQ8IYA6 745 aa15.1■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 UNC45AQ9H3U1 944 aa15.1■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 TELO2Q9Y4R8 837 aa15.1■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 WDR64B1ANS9 1081 aa15.09■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 TBX3O15119 743 aa15.09■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 CCNE2O96020 404 aa15.09■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 F13A1P00488 732 aa15.09■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 LGALS2P05162 132 aa15.09■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 PSAPP07602 524 aa15.09■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 MARK3P27448 753 aa15.09■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 JAK3P52333 1124 aa15.09■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 PTGDRQ13258 359 aa15.09■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM160B1Q5W0V3 765 aa15.09■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa15.09■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 KATNAL1Q9BW62 490 aa15.09■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM60Q9H2L4 133 aa15.09■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 KCNMB3Q9NPA1 279 aa15.09■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 DISC1Q9NRI5 854 aa15.09■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 PCDHA12Q9UN75 941 aa15.09■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 CEP131Q9UPN4 1083 aa15.09■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
PGGT1B-204ENST00000503638 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa15.08■□□□□ 0
PGGT1B-204ENST00000503638 DHX15O43143 795 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
PGGT1B-204ENST00000503638 PSMD10O75832 226 aa15.08■□□□□ 0
PGGT1B-204ENST00000503638 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa15.08■□□□□ 0
PGGT1B-204ENST00000503638 NCLP19338 710 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
PGGT1B-204ENST00000503638 SFNP31947 248 aa15.08■□□□□ 0
PGGT1B-204ENST00000503638 NKX3-2P78367 333 aa15.08■□□□□ 0
PGGT1B-204ENST00000503638 ITGA7Q13683 1181 aa15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms