RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 RXRGP48443 463 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 PRIM2P49643 509 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 CACNB3P54284 484 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 RNF220Q5VTB9 566 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 CFAP161Q6P656 301 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 FOXR1Q6PIV2 292 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 USP45Q70EL2 814 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 WFDC8Q8IUA0 241 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 PRR18Q8N4B5 295 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 KIAA1958Q8N8K9 716 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 TRIM63Q969Q1 353 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 NUP62CLQ9H1M0 184 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 VPS11Q9H270 941 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 DMRT3Q9NQL9 472 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 GPATCH2Q9NW75 528 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 RRN3Q9NYV6 651 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 SERPINB13Q9UIV8 391 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 HDAC9Q9UKV0 1011 aa5.85□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 SLC12A8A0AV02 714 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 DVL2O14641 736 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 NDUFS2O75306 463 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 CD3EP07766 207 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 ADH5P11766 374 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 PLS3P13797 630 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 PDCP20941 246 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 ABCB4P21439 1286 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 GRK3P35626 688 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 ETV3P41162 512 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 PIK3CBP42338 1070 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 PPFIA1Q13136 1202 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 MYBPC2Q14324 1141 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 TOMM20Q15388 145 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 ZNF174Q15697 407 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 MSL1Q68DK7 614 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 LETMD1Q6P1Q0 360 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 NPNTQ6UXI9 565 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 FRMD7Q6ZUT3 714 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 TMC3Q7Z5M5 1100 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 CDH24Q86UP0 819 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 MAP4K3Q8IVH8 894 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 RCBTB1Q8NDN9 531 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 MIPEPQ99797 713 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 ZMAT4Q9H898 229 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 RASSF1Q9NS23 344 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 TOMM22Q9NS69 142 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 CHST7Q9NS84 486 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 KCNK4Q9NYG8 393 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 PDP2Q9P2J9 529 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 TUBD1Q9UJT1 453 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 CDC23Q9UJX2 597 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa5.84□□□□□ -1.47
STRADB-210ENST00000498648 LCHNA4D1U4 455 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 NCAM2O15394 837 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 FIBPO43427 364 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 GSNP06396 782 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 MCCP23508 829 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 TNFSF4P23510 183 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 CD68P34810 354 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 CASP5P51878 434 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 IRF9Q00978 393 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 CRY1Q16526 586 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 CCDC184Q52MB2 194 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 TOR2AQ5JU69 321 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 IQCEQ6IPM2 695 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 MZT2BQ6NZ67 158 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 UBASH3BQ8TF42 649 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 KIAA1191Q96A73 305 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 SERINC2Q96SA4 455 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 LRFN3Q9BTN0 628 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 CERS4Q9HA82 394 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 PIDD1Q9HB75 910 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 SMURF1Q9HCE7 757 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 CATSPERZQ9NTU4 200 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 CLEC1BQ9P126 229 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 MINPP1Q9UNW1 487 aa5.83□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 A0A087WV62 115 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 CAPN8A6NHC0 703 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 NEURL1BA8MQ27 555 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 DTNBO60941 627 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 LRRN2O75325 713 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 SLITRK5O94991 958 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 PRAMEF1O95521 474 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 ALBP02768 609 aa5.82□□□□□ -1.48
STRADB-210ENST00000498648 OSMP13725 252 aa5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms