RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 PIGSQ96S52 555 aa24.09■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 TRIOO75962 3097 aa24.08■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 FIBPO43427 364 aa24.08■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 HYAL1Q12794 435 aa24.08■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.08■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 RIOX1Q9H6W3 641 aa24.08■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 C5orf42Q9H799 3197 aa24.08■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa24.08■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 MBTPS2O43462 519 aa24.07■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 CHRNA1P02708 482 aa24.07■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 LINC00271P0C7V0 271 aa24.07■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 RTEL1Q9NZ71 1219 aa24.07■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 NRCAMQ92823 1304 aa24.07■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa24.06■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 GHRP10912 638 aa24.06■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 SEMA3FQ13275 785 aa24.06■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 GRM4Q14833 912 aa24.06■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 SLC35G1Q2M3R5 365 aa24.06■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.06■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 CYB5R4Q7L1T6 521 aa24.06■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa24.06■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24.06■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 EHMT1Q9H9B1 1298 aa24.06■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 MUTYHQ9UIF7 546 aa24.06■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 FRMPD4Q14CM0 1322 aa24.06■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 DOCK5Q9H7D0 1870 aa24.05■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 SP4Q02446 784 aa24.05■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 TAF2Q6P1X5 1199 aa24.05■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 RSPH3Q86UC2 560 aa24.05■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 RNF135Q8IUD6 432 aa24.05■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 IGFLR1Q9H665 355 aa24.05■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 TECTAO75443 2155 aa24.05■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa24.04■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 ENPP3O14638 875 aa24.04■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 SENP7Q9BQF6 1050 aa24.04■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 PLVAPQ9BX97 442 aa24.04■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 CD207Q9UJ71 328 aa24.04■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 TELO2Q9Y4R8 837 aa24.04■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 TTC3P53804 2025 aa24.03■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 STXBP3O00186 592 aa24.03■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 CYTH3O43739 400 aa24.03■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 MMP1P03956 469 aa24.03■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP24.03■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 TRDNQ13061 729 aa24.03■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 LPIN1Q14693 890 aa24.03■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 RUFY4Q6ZNE9 571 aa24.03■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 SMC5Q8IY18 1101 aa24.03■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 TBX10O75333 385 aa24.02■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 CSPG5O95196 566 aa24.02■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.02■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 PPP2R3CQ969Q6 453 aa24.02■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
NELFE-210ENST00000491139 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 MGAT3Q09327 533 aa24.01■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 ADAM15Q13444 863 aa24.01■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 PCNX4Q63HM2 1172 aa24.01■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 XRRA1Q6P2D8 792 aa24.01■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 NLRX1Q86UT6 975 aa24.01■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 EDAQ92838 391 aa24.01■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 PLAGL2Q9UPG8 496 aa24.01■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa24■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 ERICH2A1L162 156 aa24■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 LINC01565O15544 149 aa24■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 DGKIO75912 1065 aa24■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 NDUFV1P49821 464 aa24■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 PPFIA1Q13136 1202 aa24■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 FBXO47Q5MNV8 452 aa24■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa24■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 PIBF1Q8WXW3 757 aa24■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 CUL5Q93034 780 aa24■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 P2RX5Q93086 422 aa24■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 TUBE1Q9UJT0 475 aa24■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 CAMK1Q14012 370 aa23.99■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa23.99■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 DNAJB3Q8WWF6 145 aa23.99■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 TROAPQ12815 778 aa23.98■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 GRIK4Q16099 956 aa23.98■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 NAALADL2Q58DX5 795 aa23.98■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 USP17L6PQ6QN14 398 aa23.98■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa23.98■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 MSLNLQ96KJ4 702 aa23.98■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 SENP2Q9HC62 589 aa23.98■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 ERAP1Q9NZ08 941 aa23.98■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 CDY2AQ9Y6F7 541 aa23.98■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 EYA4O95677 639 aa23.97■■□□□ 1.43
NELFE-210ENST00000491139 MARK3P27448 753 aa23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms