RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 ZBTB9Q96C00 473 aa18.5■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 NDST4Q9H3R1 872 aa18.5■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 SEMA3FQ13275 785 aa18.5■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 NEDD9Q14511 834 aa18.5■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 VSTM4Q8IW00 320 aa18.5■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 KIAA1586Q9HCI6 787 aa18.5■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 SERPING1P05155 500 aa18.5■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 PRPSAP1Q14558 356 aa18.5■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 ZNF34Q8IZ26 560 aa18.5■□□□□ 0.55
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NISCH-213ENST00000489895 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
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NISCH-213ENST00000489895 GUCY2FP51841 1108 aa18.49■□□□□ 0.55
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NISCH-213ENST00000489895 PANX2Q96RD6 677 aa18.49■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa18.49■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 SFNP31947 248 aa18.49■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa18.49■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
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NISCH-213ENST00000489895 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa18.49■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 H7C0C1 242 aa18.49■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 ATP5OP48047 213 aa18.49■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 MED4Q9NPJ6 270 aa18.49■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 GOLGA8CPA6NN73 597 aa18.49■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 GNAT1P11488 350 aa18.49■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
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NISCH-213ENST00000489895 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa18.49■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 ATG9AQ7Z3C6 839 aa18.49■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 PROM2Q8N271 834 aa18.49■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa18.49■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 INPP5BP32019 993 aa18.48■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
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NISCH-213ENST00000489895 CDKL2Q92772 493 aa18.48■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa18.48■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 FAM114A2Q9NRY5 505 aa18.48■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 BARHL2Q9NY43 387 aa18.48■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa18.48■□□□□ 0.55
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NISCH-213ENST00000489895 F5H6K3 240 aa18.48■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 COBLO75128 1261 aa18.48■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 KLRC3Q07444 240 aa18.48■□□□□ 0.55
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NISCH-213ENST00000489895 MSTO1Q9BUK6 570 aa18.48■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa18.48■□□□□ 0.55
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NISCH-213ENST00000489895 CD163L1Q9NR16 1453 aa18.48■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 ITKQ08881 620 aa18.48■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 TCP11X2Q5H9J9 407 aa18.48■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 ARMCX2Q7L311 632 aa18.48■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 DPH5Q9H2P9 285 aa18.48■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa18.48■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa18.47■□□□□ 0.55
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NISCH-213ENST00000489895 C10orf67Q8IYJ2 551 aa18.47■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 MCUR1Q96AQ8 359 aa18.47■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 FAM149B1Q96BN6 582 aa18.47■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 ARHGAP4P98171 946 aa18.47■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 DNAJC24Q6P3W2 148 aa18.47■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 SLC35F6Q8N357 371 aa18.47■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 PPP4R1Q8TF05 950 aa18.47■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 PXDNLA1KZ92 1463 aa18.47■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 VPS41P49754 854 aa18.47■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 SNAP25P60880 206 aa18.47■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 RFX6Q8HWS3 928 aa18.47■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
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NISCH-213ENST00000489895 LRRN2O75325 713 aa18.46■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 SRGAP2BP0DMP2 458 aa18.46■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 GARSP41250 739 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 BIRC2Q13490 618 aa18.46■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 FAM133AQ8N9E0 248 aa18.46■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 RNF146Q9NTX7 359 aa18.46■□□□□ 0.55
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NISCH-213ENST00000489895 STRIP1Q5VSL9 837 aa18.46■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 KAZNQ674X7 775 aa18.46■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 ZBTB33Q86T24 672 aa18.46■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 CCDC13Q8IYE1 715 aa18.46■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 CCDC68Q9H2F9 335 aa18.46■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 SEPT10Q9P0V9 454 aa18.46■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 GFPT2O94808 682 aa18.46■□□□□ 0.55
NISCH-213ENST00000489895 ZNF131P52739 623 aa18.46■□□□□ 0.55
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