RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 RNF38Q9H0F5 515 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 BCAS3Q9H6U6 928 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF408Q9H9D4 720 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 LAMC1P11047 1609 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 SASH1O94885 1247 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 NCAM1P13591 858 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 FBLN1P23142 703 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 MC3RP41968 323 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 MBLAC2Q68D91 279 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF227Q86WZ6 799 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 MRGPRX3Q96LB0 322 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 KCNC2Q96PR1 638 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 TESK2Q96S53 571 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 MMP19Q99542 508 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 MTA3Q9BTC8 594 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 CYP26B1Q9NR63 512 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 ABCC11Q96J66 1382 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 TBX1O43435 398 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 NTRK1P04629 796 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 ITGAVP06756 1048 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 ASGR2P07307 311 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 FOXO4P98177 505 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 SP8Q8IXZ3 490 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 STRCP1A6NGW2 1772 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 DISP3Q9P2K9 1392 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 ATF2P15336 505 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 PMLP29590 882 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 ECI1P42126 302 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 KCNJ6P48051 423 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 DIP2AQ14689 1571 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 NFIXQ14938 502 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 SLC9A5Q14940 896 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 MCF2L2Q86YR7 1114 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 BORCS6Q96GS4 357 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 WASHC2AQ641Q2 1341 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 QRICH2Q9H0J4 1663 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 AGRPO00253 132 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 MYO1BO43795 1136 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 ZBTB7AO95365 584 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 GJB6O95452 261 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 HOXC12P31275 282 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 TMF1P82094 1093 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 INF2Q27J81 1249 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 IQCEQ6IPM2 695 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 FRS2Q8WU20 508 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 DIO2Q92813 273 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 CDK19Q9BWU1 502 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 AP5M1Q9H0R1 490 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 SIT1Q9Y3P8 196 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 KIF7Q2M1P5 1343 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 PIK3R4Q99570 1358 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 TECPR2O15040 1411 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 KCNAB2Q13303 367 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 PRSS53Q2L4Q9 553 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 DLC1Q96QB1 1528 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM94Q12767 1356 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 FAM135BQ49AJ0 1406 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 KNDC1Q76NI1 1749 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 C22orf46C9J442 243 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 FFAR3O14843 346 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 CPP00450 1065 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 FPR2P25090 351 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 CYP4F3Q08477 520 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 PPIL6Q8IXY8 311 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 SYT8Q8NBV8 401 aa6.43□□□□□ -1.38
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