RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 RBL2Q08999 1139 aa15.16■□□□□ 0.02
PRAME-211ENST00000476336 PTK7Q13308 1070 aa15.16■□□□□ 0.02
PRAME-211ENST00000476336 TRIM29Q14134 588 aa15.16■□□□□ 0.02
PRAME-211ENST00000476336 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.02
PRAME-211ENST00000476336 C9orf50Q5SZB4 431 aa15.16■□□□□ 0.02
PRAME-211ENST00000476336 AFAP1L1Q8TED9 768 aa15.16■□□□□ 0.02
PRAME-211ENST00000476336 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa15.16■□□□□ 0.02
PRAME-211ENST00000476336 IL23AQ9NPF7 189 aa15.16■□□□□ 0.02
PRAME-211ENST00000476336 HDAC6Q9UBN7 1215 aa15.16■□□□□ 0.02
PRAME-211ENST00000476336 NRCAMQ92823 1304 aa15.16■□□□□ 0.02
PRAME-211ENST00000476336 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa15.15■□□□□ 0.02
PRAME-211ENST00000476336 C17orf102A2RUQ5 167 aa15.15■□□□□ 0.02
PRAME-211ENST00000476336 FAM86B1E9PN63 330 aa15.15■□□□□ 0.02
PRAME-211ENST00000476336 M0R2N6 131 aa15.15■□□□□ 0.02
PRAME-211ENST00000476336 SORBS3O60504 671 aa15.15■□□□□ 0.02
PRAME-211ENST00000476336 CAND2O75155 1236 aa15.15■□□□□ 0.02
PRAME-211ENST00000476336 FAM86B2P0C5J1 330 aa15.15■□□□□ 0.02
PRAME-211ENST00000476336 ARP10275 920 aa15.15■□□□□ 0.02
PRAME-211ENST00000476336 CSF2RAP15509 400 aa15.15■□□□□ 0.02
PRAME-211ENST00000476336 CYP2C18P33260 490 aa15.15■□□□□ 0.02
PRAME-211ENST00000476336 ZNF697Q5TEC3 545 aa15.15■□□□□ 0.02
PRAME-211ENST00000476336 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
PRAME-211ENST00000476336 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa15.15■□□□□ 0.02
PRAME-211ENST00000476336 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
PRAME-211ENST00000476336 CYP2W1Q8TAV3 490 aa15.15■□□□□ 0.02
PRAME-211ENST00000476336 GLG1Q92896 1179 aa15.15■□□□□ 0.02
PRAME-211ENST00000476336 GUCD1Q96NT3 240 aa15.15■□□□□ 0.02
PRAME-211ENST00000476336 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa15.14■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 LGR5O75473 907 aa15.14■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 ATG7O95352 703 aa15.14■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 CTDNEP1O95476 244 aa15.14■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 CYP2C9P11712 490 aa15.14■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 HOXC8P31273 242 aa15.14■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 MCM2P49736 904 aa15.14■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 KRT76Q01546 638 aa15.14■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 SP4Q02446 784 aa15.14■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 TBCKQ8TEA7 893 aa15.14■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 RIT2Q99578 217 aa15.14■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 KIF2CQ99661 725 aa15.14■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 ZNF577Q9BSK1 485 aa15.14■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 BCAS3Q9H6U6 928 aa15.14■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 TANC1Q9C0D5 1861 aa15.14■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 UNC80Q8N2C7 3258 aa15.13■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa15.13■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa15.13■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 RRN3P2A6NIE6 340 aa15.13■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 FGBP02675 491 aa15.13■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 IQCF3P0C7M6 154 aa15.13■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa15.13■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa15.13■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 ACTN1P12814 892 aa15.13■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 SELPP16109 830 aa15.13■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 CYP3A7P24462 503 aa15.13■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 ACTR2P61160 394 aa15.13■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 Q4G0T1 1027 aa15.13■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 PRR16Q569H4 304 aa15.13■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 FAM160B1Q5W0V3 765 aa15.13■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa15.13■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 SERINC5Q86VE9 423 aa15.13■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 NECAB1Q8N987 351 aa15.13■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 ATP6V0A1Q93050 837 aa15.13■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 RNPEPQ9H4A4 650 aa15.13■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 PKD2L1Q9P0L9 805 aa15.13■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 KIF3AQ9Y496 699 aa15.13■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 FDPSP14324 419 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 KRT2P35908 639 aa15.12■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 STAT5BP51692 787 aa15.12■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 CCL23P55773 120 aa15.12■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 NPY5RQ15761 445 aa15.12■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 TAF2Q6P1X5 1199 aa15.12■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 RASGRP4Q8TDF6 673 aa15.12■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 FAM161BQ96MY7 647 aa15.12■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 AIFM3Q96NN9 605 aa15.12■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 WNT8AQ9H1J5 351 aa15.12■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 SEMA6BQ9H3T3 888 aa15.12■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa15.11■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 DHX15O43143 795 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 LARGE1O95461 756 aa15.11■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 SFNP31947 248 aa15.11■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP15.11■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 TMEM240Q5SV17 173 aa15.11■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 PPP4R3AQ6IN85 833 aa15.11■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 NEK8Q86SG6 692 aa15.11■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 RSPH3Q86UC2 560 aa15.11■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 RDM1Q8NG50 284 aa15.11■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 HERVK_113Q902F9 699 aa15.11■□□□□ 0.01
PRAME-211ENST00000476336 TBC1D32Q96NH3 1257 aa15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms