RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SGCE-210ENST00000472326 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SGCE-210ENST00000472326 FAM90A27PA6NNH2 459 aa9.98□□□□□ -0.81
SGCE-210ENST00000472326 RFPL3O75679 317 aa9.98□□□□□ -0.81
SGCE-210ENST00000472326 IGFALSP35858 605 aa9.98□□□□□ -0.81
SGCE-210ENST00000472326 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SGCE-210ENST00000472326 FZD5Q13467 585 aa9.98□□□□□ -0.81
SGCE-210ENST00000472326 BTBD8Q5XKL5 378 aa9.98□□□□□ -0.81
SGCE-210ENST00000472326 LIPIQ6XZB0 460 aa9.98□□□□□ -0.81
SGCE-210ENST00000472326 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.98□□□□□ -0.81
SGCE-210ENST00000472326 SAPCD2Q86UD0 394 aa9.98□□□□□ -0.81
SGCE-210ENST00000472326 PROSER1Q86XN7 944 aa9.98□□□□□ -0.81
SGCE-210ENST00000472326 SYNPOQ8N3V7 929 aa9.98□□□□□ -0.81
SGCE-210ENST00000472326 KYQ8NBH2 561 aa9.98□□□□□ -0.81
SGCE-210ENST00000472326 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SGCE-210ENST00000472326 RIC8BQ9NVN3 520 aa9.98□□□□□ -0.81
SGCE-210ENST00000472326 ATP23Q9Y6H3 246 aa9.98□□□□□ -0.81
SGCE-210ENST00000472326 ASLP04424 464 aa9.97□□□□□ -0.81
SGCE-210ENST00000472326 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SGCE-210ENST00000472326 ADAM9Q13443 819 aa9.97□□□□□ -0.81
SGCE-210ENST00000472326 TMEM177Q53S58 311 aa9.97□□□□□ -0.81
SGCE-210ENST00000472326 PHF19Q5T6S3 580 aa9.97□□□□□ -0.81
SGCE-210ENST00000472326 CPZQ66K79 652 aa9.97□□□□□ -0.81
SGCE-210ENST00000472326 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SGCE-210ENST00000472326 NLGN4XQ8N0W4 816 aa9.97□□□□□ -0.81
SGCE-210ENST00000472326 SAMD15Q9P1V8 674 aa9.97□□□□□ -0.81
SGCE-210ENST00000472326 TLDC2A0PJX2 215 aa9.96□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 M0R2C6 588 aa9.96□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 FIGNQ5HY92 759 aa9.96□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 LINC01356Q8N9X3 169 aa9.96□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 PCDH18Q9HCL0 1135 aa9.96□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 SCDO00767 359 aa9.95□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 TRIM13O60858 407 aa9.95□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 JMJD7P0C870 316 aa9.95□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 BMP7P18075 431 aa9.95□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 THBS2P35442 1172 aa9.95□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 SEC23AQ15436 765 aa9.95□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 ENPP3O14638 875 aa9.94□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 RTP5Q14D33 572 aa9.94□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 TM4SF20Q53R12 229 aa9.94□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 PIK3R6Q5UE93 754 aa9.94□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 CD276Q5ZPR3 534 aa9.94□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 VASNQ6EMK4 673 aa9.94□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 HHIPL2Q6UWX4 724 aa9.94□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa9.94□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 NOSTRINQ8IVI9 506 aa9.94□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 C2orf69Q8N8R5 385 aa9.94□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 NINJ1Q92982 152 aa9.94□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 FEZ1Q99689 392 aa9.94□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 B4E1Z4 1266 aa9.93□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 CAP1Q01518 475 aa9.93□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa9.93□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 SIAH1Q8IUQ4 282 aa9.93□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 NIM1KQ8IY84 436 aa9.93□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 TTLL6Q8N841 843 aa9.93□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 HSPBP1Q9NZL4 362 aa9.93□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 CROTQ9UKG9 612 aa9.93□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 SH3D21A4FU49 640 aa9.92□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 PRAMEF25A6NGN4 478 aa9.92□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 KRT37O76014 449 aa9.92□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 NPTXRO95502 500 aa9.92□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa9.92□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 TTLL7Q6ZT98 887 aa9.92□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 TMEM209Q96SK2 561 aa9.92□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 SPATA25Q9BR10 227 aa9.92□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 SLC39A2Q9NP94 309 aa9.92□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 SLC12A8A0AV02 714 aa9.91□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 PFKPQ01813 784 aa9.91□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 SDE2Q6IQ49 451 aa9.91□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 CNNM4Q6P4Q7 775 aa9.91□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 CARFQ8N187 725 aa9.91□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 DTX3Q8N9I9 347 aa9.91□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 SYT8Q8NBV8 401 aa9.91□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 CLIC6Q96NY7 704 aa9.91□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 NTMQ9P121 344 aa9.91□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 FAM83GA6ND36 823 aa9.9□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 GJA4P35212 333 aa9.9□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 SLURP1P55000 103 aa9.9□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 SKIDA1Q1XH10 827 aa9.9□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 CFAP100Q494V2 611 aa9.9□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 PKN3Q6P5Z2 889 aa9.9□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 LRRTM3Q86VH5 581 aa9.9□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SGCE-210ENST00000472326 TRAF5O00463 557 aa9.89□□□□□ -0.83
SGCE-210ENST00000472326 KPNA6O60684 536 aa9.89□□□□□ -0.83
SGCE-210ENST00000472326 RPL13P26373 211 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
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