RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469534.1

ITGA6-208, Transcript of integrin subunit alpha 6, humanhuman

TSL 2

Gene ITGA6, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6-208ENST00000469534 SMARCA1P28370 1054 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 HERVK_113P62684 666 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 GRIN1Q05586 938 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 DBN1Q16643 649 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 LETM2Q2VYF4 491 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 WDR44Q5JSH3 913 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 ANO1Q5XXA6 986 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 CYP2U1Q7Z449 544 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 SAPCD2Q86UD0 394 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 NCAPG2Q86XI2 1143 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 REPS2Q8NFH8 660 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 TBCKQ8TEA7 893 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 CUL5Q93034 780 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 CLIC6Q96NY7 704 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 TRERF1Q96PN7 1200 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 PTPN18Q99952 460 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 ANO3Q9BYT9 981 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 ZMYND12Q9H0C1 365 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 TXNRD2Q9NNW7 524 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 RIC8AQ9NPQ8 531 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 SH3GLB2Q9NR46 395 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 LMBRD1Q9NUN5 540 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 COL20A1Q9P218 1284 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 DYRK1BQ9Y463 629 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 ABCB11O95342 1321 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 TMEM88BA6NKF7 163 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 GOLGA6L22H0YM25 854 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 M0R2N6 131 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 MEIS2O14770 477 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 MGAMO43451 1857 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 SLC37A4O43826 429 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 TOMM70O94826 608 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 POLR2MP0CAP2 368 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 CETPP11597 493 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 GNA11P29992 359 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 STAT3P40763 770 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 ME1P48163 572 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 GTF2A2P52657 109 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 FKBP1BP68106 108 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 POU4F2Q12837 409 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 LYPD4Q6UWN0 246 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 KRT25Q7Z3Z0 450 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 BRAPQ7Z569 592 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 DAGLBQ8NCG7 672 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 IL31RAQ8NI17 732 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 BICD2Q8TD16 824 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 GPT2Q8TD30 523 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 CLEC4DQ8WXI8 215 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 TAAR1Q96RJ0 339 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 TMEM60Q9H2L4 133 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 EFCC1Q9HA90 598 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 RTEL1Q9NZ71 1219 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 CPA4Q9UI42 421 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 HRH3Q9Y5N1 445 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 ESYT2A0FGR8 921 aa5.94□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa5.94□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 SPDYE3A6NKU9 549 aa5.94□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 PP2D1A8MPX8 630 aa5.94□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 hCG_1984214I3L0E3 225 aa5.94□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 SPTLC2O15270 562 aa5.94□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 EDIL3O43854 480 aa5.94□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 PLA2G6O60733 806 aa5.94□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 GNRH1P01148 92 aa5.94□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 PGK2P07205 417 aa5.94□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 LIG1P18858 919 aa5.94□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 ERCC3P19447 782 aa5.94□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 ZNF76P36508 570 aa5.94□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 RPS6P62753 249 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 CNTN2Q02246 1040 aa5.94□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 PTPAQ15257 358 aa5.94□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 LBX2Q6XYB7 198 aa5.94□□□□□ -1.46
ITGA6-208ENST00000469534 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms