RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463615.1

PDLIM4-205, Transcript of PDZ and LIM domain 4, humanhuman

TSL 2

Gene PDLIM4, Length 582 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM4-205ENST00000463615 CLK2P49760 499 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PDLIM4-205ENST00000463615 TAP1Q03518 808 aa23.52■■□□□ 1.36
PDLIM4-205ENST00000463615 AP3B2Q13367 1082 aa23.52■■□□□ 1.36
PDLIM4-205ENST00000463615 IKBKEQ14164 716 aa23.52■■□□□ 1.36
PDLIM4-205ENST00000463615 RPAINQ86UA6 219 aa23.52■■□□□ 1.36
PDLIM4-205ENST00000463615 MXRA8Q9BRK3 442 aa23.52■■□□□ 1.36
PDLIM4-205ENST00000463615 SETD4Q9NVD3 440 aa23.52■■□□□ 1.36
PDLIM4-205ENST00000463615 ADCY7P51828 1080 aa23.51■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa23.51■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 FAM26DQ5JW98 314 aa23.51■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa23.51■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 LMBR1Q8WVP7 490 aa23.51■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 KCNH7Q9NS40 1196 aa23.51■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 ESYT2A0FGR8 921 aa23.5■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 SMCO2A6NFE2 343 aa23.5■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 GJB5O95377 273 aa23.5■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 ADD1P35611 737 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 SREBF1P36956 1147 aa23.5■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 EVCP57679 992 aa23.5■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 DEFB103AP81534 67 aa23.5■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 Q6ZUG5 572 aa23.5■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 ANO3Q9BYT9 981 aa23.5■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 ERAP1Q9NZ08 941 aa23.5■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 NFASCO94856 1347 aa23.5■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 TLL1O43897 1013 aa23.49■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 ARHGEF15O94989 841 aa23.49■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 CPA1P15085 419 aa23.49■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 RPS6KB1P23443 525 aa23.49■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 FGD1P98174 961 aa23.49■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 SP4Q02446 784 aa23.49■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 CEP55Q53EZ4 464 aa23.49■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 DBF4BQ8NFT6 615 aa23.49■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 BRF1Q92994 677 aa23.49■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa23.49■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 MEIS1O00470 390 aa23.48■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 IGFBP4P22692 258 aa23.48■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 PSMA5P28066 241 aa23.48■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 APOBRQ0VD83 1088 aa23.48■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 TAF2Q6P1X5 1199 aa23.48■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 NIPA1Q7RTP0 329 aa23.48■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 CRYGNQ8WXF5 182 aa23.48■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 RAD9AQ99638 391 aa23.48■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 TTC28Q96AY4 2481 aa23.48■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 SCG2P13521 617 aa23.47■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 ARHGAP4P98171 946 aa23.47■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 MCTP2Q6DN12 878 aa23.47■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 CYP2W1Q8TAV3 490 aa23.47■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 ZMYND12Q9H0C1 365 aa23.47■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 SLC9A2Q9UBY0 812 aa23.47■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 TRANK1O15050 2925 aa23.46■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 VCANP13611 3396 aa23.46■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 NTRK3Q16288 839 aa23.46■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 PKN1Q16512 942 aa23.46■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 PCYT2Q99447 389 aa23.46■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 MTCH2Q9Y6C9 303 aa23.46■■□□□ 1.35
PDLIM4-205ENST00000463615 EPOPA6NHQ4 379 aa23.45■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 ATG7O95352 703 aa23.45■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 CYP3A4P08684 503 aa23.45■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 PPFIA1Q13136 1202 aa23.45■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 TJAP1Q5JTD0 557 aa23.45■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 SEPT8Q92599 483 aa23.45■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 APBB2Q92870 758 aa23.45■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 GLG1Q92896 1179 aa23.45■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 PGBD1Q96JS3 809 aa23.45■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 ZBED2Q9BTP6 218 aa23.45■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 MICAL3Q7RTP6 2002 aa23.45■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 KAT6AQ92794 2004 aa23.45■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 LCHNA4D1U4 455 aa23.44■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 AMHP03971 560 aa23.44■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 ARP10275 920 aa23.44■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 GRIK4Q16099 956 aa23.44■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 MARCH8Q5T0T0 291 aa23.44■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa23.44■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 SDF4Q9BRK5 362 aa23.44■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 PRDM6Q9NQX0 595 aa23.44■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 TMEM260Q9NX78 707 aa23.44■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.44■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 THEGQ9P2T0 379 aa23.44■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 RRN3P2A6NIE6 340 aa23.43■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 CTSHP09668 335 aa23.43■■□□□ 1.34
PDLIM4-205ENST00000463615 ACTR2P61160 394 aa23.43■■□□□ 1.34
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