RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP26Q9BXU7 913 aa9.74□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.74□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 SETD4Q9NVD3 440 aa9.74□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa9.74□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 RSPH10B2B2RC85 870 aa9.73□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIF28PB7ZC32 967 aa9.73□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 CTSHP09668 335 aa9.73□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 RSPH10BP0C881 870 aa9.73□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIF5BP33176 963 aa9.73□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 THPOP40225 353 aa9.73□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.73□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 MGAT3Q09327 533 aa9.73□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 IKBKEQ14164 716 aa9.73□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADCK5Q3MIX3 580 aa9.73□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 BMP2KLQ5H9B9 411 aa9.73□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM26DQ5JW98 314 aa9.73□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 APOA5Q6Q788 366 aa9.73□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa9.73□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPRASP2Q96D09 838 aa9.73□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 TCEANC2Q96MN5 208 aa9.73□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCYT2Q99447 389 aa9.73□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAD9AQ99638 391 aa9.73□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 LZTS2Q9BRK4 669 aa9.73□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 BRPF3Q9ULD4 1205 aa9.73□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 EMSYQ7Z589 1322 aa9.73□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRIP11Q15643 1979 aa9.72□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC69A6NI79 296 aa9.72□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 NOP56O00567 594 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADAMTS3O15072 1205 aa9.72□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 EFCAB14O75071 495 aa9.72□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHRNA1P02708 482 aa9.72□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC00271P0C7V0 271 aa9.72□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 GNAQP50148 359 aa9.72□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 SP4Q02446 784 aa9.72□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 MARCH8Q5T0T0 291 aa9.72□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 WWC2Q6AWC2 1192 aa9.72□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM117BQ6P1L5 589 aa9.72□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 XRRA1Q6P2D8 792 aa9.72□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 RUFY4Q6ZNE9 571 aa9.72□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 MICU3Q86XE3 530 aa9.72□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMTC2Q8N394 836 aa9.72□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC82Q8N4S0 544 aa9.72□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 FANCBQ8NB91 859 aa9.72□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 C17orf80Q9BSJ5 609 aa9.72□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANO2Q9NQ90 1003 aa9.72□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 MTUS1Q9ULD2 1270 aa9.72□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 KMT2EQ8IZD2 1858 aa9.71□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 CAND2O75155 1236 aa9.71□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 CALM1P0DP23 149 aa9.71□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 CALM2P0DP24 149 aa9.71□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 CALM3P0DP25 149 aa9.71□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDC27P30260 824 aa9.71□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 TSGA10IPQ3SY00 556 aa9.71□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 NFXL1Q6ZNB6 911 aa9.71□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPAINQ86UA6 219 aa9.71□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYOCDQ8IZQ8 938 aa9.71□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYP2W1Q8TAV3 490 aa9.71□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 CUL5Q93034 780 aa9.71□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 TOP1MTQ969P6 601 aa9.71□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZBTB10Q96DT7 871 aa9.71□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 PGBD1Q96JS3 809 aa9.71□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 PSTPIP2Q9H939 334 aa9.71□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 EHMT1Q9H9B1 1298 aa9.71□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 LMCD1Q9NZU5 365 aa9.71□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCDHA6Q9UN73 950 aa9.71□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa9.71□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC12A7Q9Y666 1083 aa9.71□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 C2orf16Q68DN1 1984 aa9.71□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRIOO75962 3097 aa9.7□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLK2P49760 499 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARHGAP4P98171 946 aa9.7□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 NLRX1Q86UT6 975 aa9.7□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 CRYGNQ8WXF5 182 aa9.7□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC01599Q8WXQ3 324 aa9.7□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 NEK1Q96PY6 1258 aa9.7□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZBED2Q9BTP6 218 aa9.7□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 JADE2Q9NQC1 790 aa9.7□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 PKD2L1Q9P0L9 805 aa9.7□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 NRCAMQ92823 1304 aa9.7□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 NID2Q14112 1375 aa9.7□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 DENND4AQ7Z401 1863 aa9.7□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 TECTAO75443 2155 aa9.7□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 STXBP3O00186 592 aa9.69□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 AMHP03971 560 aa9.69□□□□□ -0.86
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARP10275 920 aa9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms