RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443090.1

GCSHP5-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 5, humanhuman

BASIC

Gene GCSHP5, Length 522 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP5-201ENST00000443090 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.9■■□□□ 1.26
GCSHP5-201ENST00000443090 PRC1O43663 620 aa22.89■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 KCNA2P16389 499 aa22.89■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 GNAQP50148 359 aa22.89■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 SP4Q02446 784 aa22.89■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 RPAINQ86UA6 219 aa22.89■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 GPRASP2Q96D09 838 aa22.89■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 H3BNC9 293 aa22.88■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 ATP9AO75110 1047 aa22.88■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 CASC1Q6TDU7 716 aa22.88■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 CD320Q9NPF0 282 aa22.88■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 UPP2O95045 317 aa22.87■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 CHRNA1P02708 482 aa22.87■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 ITGB5P18084 799 aa22.87■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 KCNA5P22460 613 aa22.87■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 PLA2G5P39877 138 aa22.87■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 PTPROQ16827 1216 aa22.87■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 TIGD5Q53EQ6 642 aa22.87■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.87■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 TMTC2Q8N394 836 aa22.87■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 CDHR1Q96JP9 859 aa22.87■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 TMEM87BQ96K49 555 aa22.87■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 LRFN3Q9BTN0 628 aa22.87■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.87■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.86■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 MCM5P33992 734 aa22.86■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 LIFRP42702 1097 aa22.86■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 MGAT3Q09327 533 aa22.86■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.86■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 TMEM192Q8IY95 271 aa22.86■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.86■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 GPM6BQ13491 265 aa22.85■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 COL19A1Q14993 1142 aa22.85■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.85■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.85■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.85■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.85■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.85■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.84■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 MYO7AQ13402 2215 aa22.84■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 CCDC69A6NI79 296 aa22.84■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 LINC00271P0C7V0 271 aa22.84■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 CALM1P0DP23 149 aa22.84■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 CALM2P0DP24 149 aa22.84■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 CALM3P0DP25 149 aa22.84■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 GHRP10912 638 aa22.84■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 RXRAP19793 462 aa22.84■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 PPFIA1Q13136 1202 aa22.84■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 TMEM31Q5JXX7 168 aa22.84■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 BANK1Q8NDB2 785 aa22.84■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 NEK9Q8TD19 979 aa22.84■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.84■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 SLC27A2O14975 620 aa22.83■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 MTMR1Q13613 665 aa22.83■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 LPIN1Q14693 890 aa22.83■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 GRIK4Q16099 956 aa22.83■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 UBE2SQ16763 222 aa22.83■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 MARCH8Q5T0T0 291 aa22.83■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.83■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 IL17RAQ96F46 866 aa22.83■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 TUBE1Q9UJT0 475 aa22.83■■□□□ 1.25
GCSHP5-201ENST00000443090 TTC3P53804 2025 aa22.82■■□□□ 1.24
GCSHP5-201ENST00000443090 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.82■■□□□ 1.24
GCSHP5-201ENST00000443090 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.82■■□□□ 1.24
GCSHP5-201ENST00000443090 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.82■■□□□ 1.24
GCSHP5-201ENST00000443090 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.82■■□□□ 1.24
GCSHP5-201ENST00000443090 GPR37L1O60883 481 aa22.82■■□□□ 1.24
GCSHP5-201ENST00000443090 IL9P15248 144 aa22.82■■□□□ 1.24
GCSHP5-201ENST00000443090 MARK3P27448 753 aa22.82■■□□□ 1.24
GCSHP5-201ENST00000443090 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.82■■□□□ 1.24
GCSHP5-201ENST00000443090 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
GCSHP5-201ENST00000443090 FAM122AQ96E09 287 aa22.82■■□□□ 1.24
GCSHP5-201ENST00000443090 JADE2Q9NQC1 790 aa22.82■■□□□ 1.24
GCSHP5-201ENST00000443090 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
GCSHP5-201ENST00000443090 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
GCSHP5-201ENST00000443090 FBXO47Q5MNV8 452 aa22.81■■□□□ 1.24
GCSHP5-201ENST00000443090 RSPH3Q86UC2 560 aa22.81■■□□□ 1.24
GCSHP5-201ENST00000443090 GJD3Q8N144 294 aa22.81■■□□□ 1.24
GCSHP5-201ENST00000443090 FIBCD1Q8N539 461 aa22.81■■□□□ 1.24
GCSHP5-201ENST00000443090 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
GCSHP5-201ENST00000443090 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.81■■□□□ 1.24
GCSHP5-201ENST00000443090 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
GCSHP5-201ENST00000443090 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.81■■□□□ 1.24
GCSHP5-201ENST00000443090 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.81■■□□□ 1.24
GCSHP5-201ENST00000443090 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.81■■□□□ 1.24
GCSHP5-201ENST00000443090 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.81■■□□□ 1.24
GCSHP5-201ENST00000443090 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.8■■□□□ 1.24
GCSHP5-201ENST00000443090 MAFGO15525 162 aa22.8■■□□□ 1.24
GCSHP5-201ENST00000443090 NECTIN1Q15223 517 aa22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms