RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa23.06■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.283e-7■□□□□ 10.9
HLA-B-250ENST00000434333 LMBR1Q8WVP7 490 aa23.06■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 MTCH2Q9Y6C9 303 aa23.06■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 XIRP2A4UGR9 3374 aa23.06■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa23.05■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 GOLGA8AA7E2F4 631 aa23.05■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 GOLGA8BA8MQT2 603 aa23.05■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 CAND2O75155 1236 aa23.05■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 PPP1R18Q6NYC8 613 aa23.05■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 ARNTL2Q8WYA1 636 aa23.05■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 RIC8AQ9NPQ8 531 aa23.05■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 STXBP3O00186 592 aa23.04■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 CTSHP09668 335 aa23.04■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 GNAT1P11488 350 aa23.04■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 CPA1P15085 419 aa23.04■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 RCAN1P53805 252 aa23.04■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 NAPAP54920 295 aa23.04■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 KRT40Q6A162 431 aa23.04■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 SEPT1Q8WYJ6 367 aa23.04■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 PGBD1Q96JS3 809 aa23.04■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.04■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 V9GY48 417 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 TTC28Q96AY4 2481 aa23.04■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 MAFGO15525 162 aa23.03■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 LPXNO60711 386 aa23.03■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
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HLA-B-250ENST00000434333 TEX2Q8IWB9 1127 aa23.03■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 MICALL1Q8N3F8 863 aa23.03■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 CYP2W1Q8TAV3 490 aa23.03■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 RAD9AQ99638 391 aa23.03■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 MXRA8Q9BRK3 442 aa23.03■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 ZBED2Q9BTP6 218 aa23.03■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 BARHL2Q9NY43 387 aa23.03■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 NRCAMQ92823 1304 aa23.03■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 SIP14410 1827 aa23.03■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 hCG_1984214I3L0E3 225 aa23.02■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 HSPA4P34932 840 aa23.02■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 CLK2P49760 499 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 GRB10Q13322 594 aa23.02■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 FAM26DQ5JW98 314 aa23.02■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 ASB2Q96Q27 587 aa23.02■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 PCYT2Q99447 389 aa23.02■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 ANO3Q9BYT9 981 aa23.02■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 EHMT1Q9H9B1 1298 aa23.02■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 KCNH7Q9NS40 1196 aa23.02■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 SNX14Q9Y5W7 946 aa23.02■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 ADD1P35611 737 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 RUFY4Q6ZNE9 571 aa23.01■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 TMEM260Q9NX78 707 aa23.01■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 KAT6AQ92794 2004 aa23.01■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 NID2Q14112 1375 aa23.01■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 LINC01553A4QN01 128 aa23■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 SMCO2A6NFE2 343 aa23■■□□□ 1.27
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HLA-B-250ENST00000434333 APOBRQ0VD83 1088 aa23■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 FAM117BQ6P1L5 589 aa23■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 Q6ZUG5 572 aa23■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 RPAINQ86UA6 219 aa23■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 CCDC136Q96JN2 1154 aa23■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 ERAP1Q9NZ08 941 aa23■■□□□ 1.27
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HLA-B-250ENST00000434333 SREBF1P36956 1147 aa22.99■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 ERVK-21P61565 698 aa22.99■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 PPFIA1Q13136 1202 aa22.99■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 MARCH8Q5T0T0 291 aa22.99■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.99■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 SEPT8Q92599 483 aa22.99■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.99■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.99■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.99■■□□□ 1.27
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HLA-B-250ENST00000434333 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
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HLA-B-250ENST00000434333 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
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HLA-B-250ENST00000434333 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 AP3B2Q13367 1082 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 GRIK4Q16099 956 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 CEP55Q53EZ4 464 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 FBXL16Q8N461 479 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 GLG1Q92896 1179 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 BRF1Q92994 677 aa22.98■■□□□ 1.27
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