RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423945.5

SBDSP1-202, Transcript of SBDS, ribosome maturation factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SBDSP1, Length 618 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBDSP1-202ENST00000423945 GUCD1Q96NT3 240 aa20.35■□□□□ 0.85
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SBDSP1-202ENST00000423945 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
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SBDSP1-202ENST00000423945 KAT6AQ92794 2004 aa20.35■□□□□ 0.85
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SBDSP1-202ENST00000423945 CHD9Q3L8U1 2897 aa20.35■□□□□ 0.85
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SBDSP1-202ENST00000423945 TREHO43280 583 aa20.34■□□□□ 0.85
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SBDSP1-202ENST00000423945 GNA11P29992 359 aa20.34■□□□□ 0.85
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SBDSP1-202ENST00000423945 PBX2P40425 430 aa20.34■□□□□ 0.85
SBDSP1-202ENST00000423945 ADAM17P78536 824 aa20.34■□□□□ 0.85
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SBDSP1-202ENST00000423945 C8orf34Q49A92 452 aa20.34■□□□□ 0.85
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SBDSP1-202ENST00000423945 OSBPL7Q9BZF2 842 aa20.3■□□□□ 0.84
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SBDSP1-202ENST00000423945 ANKRD1Q15327 319 aa20.29■□□□□ 0.84
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SBDSP1-202ENST00000423945 STK36Q9NRP7 1315 aa20.28■□□□□ 0.84
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SBDSP1-202ENST00000423945 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa20.28■□□□□ 0.84
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SBDSP1-202ENST00000423945 ST3GAL1Q11201 340 aa20.28■□□□□ 0.84
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SBDSP1-202ENST00000423945 ABHD15Q6UXT9 468 aa20.28■□□□□ 0.84
SBDSP1-202ENST00000423945 RUFY4Q6ZNE9 571 aa20.28■□□□□ 0.84
SBDSP1-202ENST00000423945 BLIDQ8IZY5 108 aa20.28■□□□□ 0.84
SBDSP1-202ENST00000423945 GLG1Q92896 1179 aa20.28■□□□□ 0.84
SBDSP1-202ENST00000423945 TIFAQ96CG3 184 aa20.28■□□□□ 0.84
SBDSP1-202ENST00000423945 KCNJ14Q9UNX9 436 aa20.28■□□□□ 0.84
SBDSP1-202ENST00000423945 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa20.28■□□□□ 0.84
SBDSP1-202ENST00000423945 EYSQ5T1H1 3165 aa20.27■□□□□ 0.84
SBDSP1-202ENST00000423945 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SBDSP1-202ENST00000423945 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
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