RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 ACTR2P61160 394 aa17.42■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 KRT76Q01546 638 aa17.42■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 KIAA0753Q2KHM9 967 aa17.42■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 SESTD1Q86VW0 696 aa17.42■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM126BQ8IXS8 530 aa17.42■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 GLG1Q92896 1179 aa17.42■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 LENG9Q96B70 501 aa17.42■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 MBOAT7Q96N66 472 aa17.42■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 C16orf70Q9BSU1 422 aa17.42■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 PRO3102Q9H379 93 aa17.42■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa17.42■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 NOD1Q9Y239 953 aa17.42■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa17.41■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 HAS3O00219 553 aa17.41■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 MSH4O15457 936 aa17.41■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 TDP2O95551 362 aa17.41■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 SYN1P17600 705 aa17.41■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa17.41■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 LRCH3Q96II8 777 aa17.41■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM20AQ96MK3 541 aa17.41■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 TEKT3Q9BXF9 490 aa17.41■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 PDLIM7Q9NR12 457 aa17.41■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 ERAP1Q9NZ08 941 aa17.41■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 KIAA0355O15063 1070 aa17.4■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 TBX3O15119 743 aa17.4■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 DHX15O43143 795 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 EDIL3O43854 480 aa17.4■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 BAG4O95429 457 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 GNAT1P11488 350 aa17.4■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 FAAP100Q0VG06 881 aa17.4■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 LRCH2Q5VUJ6 765 aa17.4■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM160B1Q5W0V3 765 aa17.4■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 NOSTRINQ8IVI9 506 aa17.4■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC5A5Q92911 643 aa17.4■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 DNAH12Q6ZR08 3092 aa17.39■□□□□ 0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 WDR64B1ANS9 1081 aa17.39■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 BACH1O14867 736 aa17.39■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 LGR5O75473 907 aa17.39■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 CD4P01730 458 aa17.39■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 RAG1P15918 1043 aa17.39■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 SFNP31947 248 aa17.39■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 TRAPPC10P48553 1259 aa17.39■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC26A2P50443 739 aa17.39■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 STAT5BP51692 787 aa17.39■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 MCTP1Q6DN14 999 aa17.39■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa17.39■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 SLFN12Q8IYM2 578 aa17.39■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 TRPV6Q9H1D0 765 aa17.39■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 HDAC6Q9UBN7 1215 aa17.39■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 SAMM50Q9Y512 469 aa17.39■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa17.39■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 EMSYQ7Z589 1322 aa17.39■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 B4GALT4O60513 344 aa17.38■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 ATG7O95352 703 aa17.38■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 PSAPP07602 524 aa17.38■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP17.38■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 JAK3P52333 1124 aa17.38■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 PTGISQ16647 500 aa17.38■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 RDM1Q8NG50 284 aa17.38■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 ETNPPLQ8TBG4 499 aa17.38■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 UIMC1Q96RL1 719 aa17.38■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa17.38■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 DOCK5Q9H7D0 1870 aa17.37■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 C17orf102A2RUQ5 167 aa17.37■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM205CA6NFA0 338 aa17.37■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC37A4O43826 429 aa17.37■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 PSMD10O75832 226 aa17.37■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 CCNE2O96020 404 aa17.37■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 ABHD15Q6UXT9 468 aa17.37■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM50Q86XT4 487 aa17.37■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC155Q8N6L0 562 aa17.37■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF302Q9NR11 478 aa17.37■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 DISC1Q9NRI5 854 aa17.37■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 TBX21Q9UL17 535 aa17.37■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 TELO2Q9Y4R8 837 aa17.37■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa17.36■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM43BA6NCK2 446 aa17.36■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 NEMFO60524 1076 aa17.36■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 TIMP1P01033 207 aa17.36■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa17.36■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa17.36■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP2B1P20020 1258 aa17.36■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 BFSP2Q13515 415 aa17.36■□□□□ 0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 CALCRLQ16602 461 aa17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms