RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 CNKSR3Q6P9H4 555 aa26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 CYP2W1Q8TAV3 490 aa26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 MXRA8Q9BRK3 442 aa26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 CHD9Q3L8U1 2897 aa26.87■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 MAFGO15525 162 aa26.87■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 SCG2P13521 617 aa26.87■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 THPOP40225 353 aa26.87■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 PPP2R2DQ66LE6 453 aa26.87■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP26.87■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 SEPT1Q8WYJ6 367 aa26.87■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 PKN1Q16512 942 aa26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 HERC6Q8IVU3 1022 aa26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 KCNH7Q9NS40 1196 aa26.86■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 ARP10275 920 aa26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 KCNJ6P48051 423 aa26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 WDR5P61964 334 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 ADAM17P78536 824 aa26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 AP3B2Q13367 1082 aa26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 PHKBQ93100 1093 aa26.85■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 RSPH10B2B2RC85 870 aa26.84■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 ADAMTS3O15072 1205 aa26.84■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 CA3P07451 260 aa26.84■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 RSPH10BP0C881 870 aa26.84■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 GNAT1P11488 350 aa26.84■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 SREBF1P36956 1147 aa26.84■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 ADGRE1Q14246 886 aa26.84■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 NTRK3Q16288 839 aa26.84■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa26.84■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 LMBR1Q8WVP7 490 aa26.84■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 IL17RAQ96F46 866 aa26.84■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 EYSQ5T1H1 3165 aa26.84■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 DLL1O00548 723 aa26.83■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 PPFIA3O75145 1194 aa26.83■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 CCT2P78371 535 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 DEFB103AP81534 67 aa26.83■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 ARHGAP4P98171 946 aa26.83■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 CEP55Q53EZ4 464 aa26.83■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 USP38Q8NB14 1042 aa26.83■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa26.82■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 ESYT2A0FGR8 921 aa26.82■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 LGR5O75473 907 aa26.82■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 MARK3P27448 753 aa26.82■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 MCTP2Q6DN12 878 aa26.82■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 ZMYND12Q9H0C1 365 aa26.82■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 PDRG1Q9NUG6 133 aa26.82■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 SLC9A2Q9UBY0 812 aa26.82■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 MICAL3Q7RTP6 2002 aa26.82■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 MEIS1O00470 390 aa26.81■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 ARHGEF15O94989 841 aa26.81■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 CTSHP09668 335 aa26.81■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 IFNAR1P17181 557 aa26.81■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 DBF4BQ8NFT6 615 aa26.81■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 GLG1Q92896 1179 aa26.81■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 PCYT2Q99447 389 aa26.81■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 OSBPL7Q9BZF2 842 aa26.81■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa26.81■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 ERAP1Q9NZ08 941 aa26.81■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 NFASCO94856 1347 aa26.81■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 EMSYQ7Z589 1322 aa26.81■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 NRCAMQ92823 1304 aa26.81■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 KIF28PB7ZC32 967 aa26.8■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 CAND2O75155 1236 aa26.8■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 IGFBP4P22692 258 aa26.8■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF76P36508 570 aa26.8■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 IKBKEQ14164 716 aa26.8■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 SDF4Q9BRK5 362 aa26.8■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 SLC26A6Q9BXS9 759 aa26.8■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 C6orf50Q9HD87 102 aa26.8■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 UNC80Q8N2C7 3258 aa26.79■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 TLL1O43897 1013 aa26.79■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 PPFIA1Q13136 1202 aa26.79■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 ANKRD1Q15327 319 aa26.79■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 CRYGNQ8WXF5 182 aa26.79■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 CERS4Q9HA82 394 aa26.79■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 CHD7Q9P2D1 2997 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 FAM86B1E9PN63 330 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 EFCAB14O75071 495 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 FAM86B2P0C5J1 330 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 ACTR2P61160 394 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 TAP1Q03518 808 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 GRIK4Q16099 956 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-201ENST00000378543 RUFY4Q6ZNE9 571 aa26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms