RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364771.1

RNU6-1187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1187P, Length 110 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1187P-201ENST00000364771 A0A1W2PQ67 120 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 BICDL2A1A5D9 508 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 SYCE3A1L190 88 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 TRIM43BA6NCK2 446 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 TMEM247A6NEH6 219 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 GOLGA6L10A6NI86 522 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 LRRC72A6NJI9 287 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 TBKBP1A7MCY6 615 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 C19orf81C9J6K1 198 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 RASA4BC9J798 803 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 H3BQF6 201 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 MYO1FO00160 1098 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 MASP2O00187 686 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 NDUFAB1O14561 156 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 KIF3BO15066 747 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 CHUKO15111 745 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 P4HA2O15460 535 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 RASA4O43374 803 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 SGTAO43765 313 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 AHCYL1O43865 530 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 AKR1B10O60218 316 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 KATNA1O75449 491 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 LGR5O75473 907 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 ERLIN1O75477 346 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 LDHBP07195 334 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 FESP07332 822 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 VIMP08670 466 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 VIL1P09327 827 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 LINGO3P0C6S8 592 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 MSL3P1P0C860 447 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 MYBL1P10243 752 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 PDHBP11177 359 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 COL6A1P12109 1028 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 GLULP15104 373 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 CNGA1P29973 690 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 HOXC13P31276 330 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 HOXD12P35452 270 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 ADD2P35612 726 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 CHKAP35790 457 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 SLC16A2P36021 539 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 PIK3CAP42336 1068 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 USP5P45974 858 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 FNTAP49354 379 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 PDE6CP51160 858 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 PSMD7P51665 324 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 GUCY2FP51841 1108 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 NEK2P51955 445 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 ZNF131P52739 623 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 RCAN1P53805 252 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 TBX4P57082 545 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 SLC8A3P57103 927 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 C21orf58P58505 322 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 GNAI1P63096 354 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 CTAG1AP78358 180 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 CYP4A11Q02928 519 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 FAM160A1Q05DH4 1040 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 DDR1Q08345 913 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 BNIP1Q12981 228 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 CBX3Q13185 183 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 BIRC3Q13489 604 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 CUL3Q13618 768 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 CUL4BQ13620 913 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 TRIM29Q14134 588 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 KCTD2Q14681 263 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 SLMAPQ14BN4 828 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 WTAPQ15007 396 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 SEPT2Q15019 361 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 RAB3GAP1Q15042 981 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 RASA2Q15283 850 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 AMHR2Q16671 573 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 NKPD1Q17RQ9 610 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 WASHC4Q2M389 1173 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 KLHL40Q2TBA0 621 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 MAP7D1Q3KQU3 841 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 SLFNL1Q499Z3 407 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 ACCSLQ4AC99 568 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 FILIP1LQ4L180 1135 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 PARP10Q53GL7 1025 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 CCDC93Q567U6 631 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 AKAP4Q5JQC9 854 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-1187P-201ENST00000364771 SPDYCQ5MJ68 293 aa1.07□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms