RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359175.8

SPTSSB-201, Transcript of serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTSSB, Length 3,103 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSB-201ENST00000359175 ZSWIM5Q9P217 1185 aa14.52□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
SPTSSB-201ENST00000359175 MYH6P13533 1939 aa14.52□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 O00370 1275 aa14.52□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 RHOBTB3O94955 611 aa14.52□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 XBP1P17861 261 aa14.52□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 PSMC4P43686 418 aa14.52□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 RNF220Q5VTB9 566 aa14.52□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 SHISA4Q96DD7 197 aa14.52□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.52□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 TXLNGYQ9BZA5 131 aa14.52□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 MTFR1LQ9H019 292 aa14.52□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 EYA2O00167 538 aa14.51□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 PDHA1P08559 390 aa14.51□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 MYL6BP14649 208 aa14.51□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 ALDH1B1P30837 517 aa14.51□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 PEX5P50542 639 aa14.51□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 EHHADHQ08426 723 aa14.51□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 TTC38Q5R3I4 469 aa14.51□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 SESTD1Q86VW0 696 aa14.51□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 ACTRT1Q8TDG2 376 aa14.51□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 SELENOSQ9BQE4 189 aa14.51□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 SLIT3O75094 1523 aa14.51□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 BICDL2A1A5D9 508 aa14.51□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 LRRC53A6NM62 1247 aa14.51□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 EPHB6O15197 1021 aa14.51□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 KLRC4O43908 158 aa14.51□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 SUN1O94901 812 aa14.51□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 SHBGP04278 402 aa14.51□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 GSTA2P09210 222 aa14.51□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 NUDT17P0C025 328 aa14.51□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 DNA2P51530 1060 aa14.51□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 RCAN1P53805 252 aa14.51□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 POLE2P56282 527 aa14.51□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.51□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 ATRNO75882 1429 aa14.51□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 CIAO1O76071 339 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 CCNE1P24864 410 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 FOXB2Q5VYV0 432 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 FGD4Q96M96 766 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 RXFP1Q9HBX9 757 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 DAPK3O43293 454 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 GJB6O95452 261 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 LRRC24Q50LG9 513 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 IRGCQ6NXR0 463 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 STK32AQ8WU08 396 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 BAP1Q92560 729 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 TAF4BQ92750 862 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 P2RX5Q93086 422 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 OCEL1Q9H607 264 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 FAM114A2Q9NRY5 505 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 CCDC188H7C350 402 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 TPBGLP0DKB5 382 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 RFC5P40937 340 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 RAD23BP54727 409 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 TCIRG1Q13488 830 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 HGSNATQ68CP4 663 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 RRAGAQ7L523 313 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 TRIM42Q8IWZ5 723 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 FAM136AQ96C01 138 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 GGT7Q9UJ14 662 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 STAT6P42226 847 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 ZAP70P43403 619 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 IL17AQ16552 155 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 PARP6Q2NL67 630 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 PHC3Q8NDX5 983 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 TNFRSF25Q93038 417 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 TRIM7Q9C029 511 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 TMEM165Q9HC07 324 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 CCDC169A6NNP5 214 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 PEX11AO75192 247 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 PENKP01210 267 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 ITGA6P23229 1130 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 ANKRD40Q6AI12 368 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 TMC4Q7Z404 712 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SPTSSB-201ENST00000359175 SYCP3Q8IZU3 236 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms