RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 RSPH1Q8WYR4 309 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 CNBD2Q96M20 576 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 CLIC4Q9Y696 253 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP8B3O60423 1300 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 DNAL1Q4LDG9 190 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 PDIK1LQ8N165 341 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 PROM2Q8N271 834 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 TTC13Q8NBP0 860 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 RASSF9O75901 435 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 IFNB1P01574 187 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 MORF4L2Q15014 288 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF827Q17R98 1081 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 GRAMD1BQ3KR37 738 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 BSPRYQ5W0U4 402 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 MAEAQ7L5Y9 396 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC13A4Q9UKG4 626 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 TTLL3Q9Y4R7 772 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 A6NJR5 290 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 SMAPO00193 183 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 MYCT1Q8N699 235 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 THAP9Q9H5L6 903 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 TTC39CQ8N584 583 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 TUBGCP3Q96CW5 907 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 HDAC11Q96DB2 347 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 E7EWF7 191 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 ARHGAP44Q17R89 818 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 CHMP6Q96FZ7 201 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 PKD2L2Q9NZM6 624 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP11.41□□□□□ -0.585e-14■■■□□ 16
SH3BP2-201ENST00000356331 TRPV6Q9H1D0 765 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIM69Q86WT6 500 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 DDI1Q8WTU0 396 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 PITPNM3Q9BZ71 974 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 LRWD1Q9UFC0 647 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 ZBBXA8MT70 800 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 RPN1P04843 607 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 IL1RL1Q01638 556 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 VPS39Q96JC1 886 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF839A8K0R7 811 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 KIAA2013Q8IYS2 634 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 ETAA1Q9NY74 926 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 NPATQ14207 1427 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 SURF1Q15526 300 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC144BQ3MJ40 725 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 KAZNQ674X7 775 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 TTLL11Q8NHH1 800 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 CYTH2Q99418 400 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 DIAPH2O60879 1101 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 LDHBP07195 334 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 PTPREP23469 700 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 SERPINB1P30740 379 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 CASP2P42575 452 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 MFAP3P55082 362 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 SCRN1Q12765 414 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 SH3GL2Q99962 352 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 STMN3Q9NZ72 180 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 GSNP06396 782 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 PURAQ00577 322 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 TSPY1Q01534 308 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 RNF169Q8NCN4 708 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 GUCY1A3Q02108 690 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 ASXL2Q76L83 1435 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 ACADSP16219 412 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BP2-201ENST00000356331 TXKP42681 527 aa11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms