RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 PTPROQ16827 1216 aa16.75■□□□□ 0.27
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PTPRO-202ENST00000348962 THNSL1Q8IYQ7 743 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 SCYL1Q96KG9 808 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 RCOR1Q9UKL0 485 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 THEM5Q8N1Q8 247 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 UBN2Q6ZU65 1347 aa16.74■□□□□ 0.27
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PTPRO-202ENST00000348962 F5H6K3 240 aa16.74■□□□□ 0.27
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PTPRO-202ENST00000348962 KLRC3Q07444 240 aa16.74■□□□□ 0.27
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PTPRO-202ENST00000348962 ATP11AP98196 1134 aa16.74■□□□□ 0.27
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PTPRO-202ENST00000348962 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP16.73■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
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PTPRO-202ENST00000348962 USP17L15C9J2P7 530 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 USP17L13C9JLJ4 530 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 USP17L11C9JVI0 530 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 USP17L18D6R9N7 530 aa16.73■□□□□ 0.27
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PTPRO-202ENST00000348962 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 KCNH4Q9UQ05 1017 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
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PTPRO-202ENST00000348962 SAT1P21673 171 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 CASP14P31944 242 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
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PTPRO-202ENST00000348962 CEP95Q96GE4 821 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 MMP19Q99542 508 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 NUF2Q9BZD4 464 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 POLIQ9UNA4 740 aa16.72■□□□□ 0.27
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PTPRO-202ENST00000348962 PRELPP51888 382 aa16.72■□□□□ 0.27
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PTPRO-202ENST00000348962 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 ZBBXA8MT70 800 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 F8W8V4 182 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 PRPSAP2O60256 369 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 ECE1P42892 770 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 ETF1P62495 437 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 CCDC13Q8IYE1 715 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
PTPRO-202ENST00000348962 SGK1O00141 431 aa16.71■□□□□ 0.27
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