RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317868.8

ATG4C-201, Transcript of autophagy related 4C cysteine peptidase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG4C, Length 2,938 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4C-201ENST00000317868 TRAF5O00463 557 aa15.23■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 POTEIP0CG38 1075 aa15.23■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 HOXD13P35453 343 aa15.23■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 DCAF8Q5TAQ9 597 aa15.23■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 POTEGQ6S5H5 508 aa15.23■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 POTEEQ6S8J3 1075 aa15.23■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 FBXO11Q86XK2 927 aa15.23■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 KCTD17Q8N5Z5 321 aa15.23■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 GANQ9H2C0 597 aa15.23■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 VIPAS39Q9H9C1 493 aa15.23■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 MACROD2A1Z1Q3 448 aa15.23■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 CASP8Q14790 479 aa15.23■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 PSD3Q9NYI0 1048 aa15.23■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF185O15231 689 aa15.23■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 CASP5P51878 434 aa15.23■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 PSMC6P62333 389 aa15.23■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 RUBCNQ92622 972 aa15.23■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 PKNOX2Q96KN3 472 aa15.23■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 MLXIPQ9HAP2 919 aa15.23■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 PARP14Q460N5 1801 aa15.22■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa15.22■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 A0A1W2PRG0 241 aa15.22■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 MARCH6O60337 910 aa15.22■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 GDF11O95390 407 aa15.22■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 FAM83BQ5T0W9 1011 aa15.22■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 MMGT1Q8N4V1 131 aa15.22■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 AIPL1Q9NZN9 384 aa15.22■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 WDR81Q562E7 1941 aa15.22■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 MSH4O15457 936 aa15.22■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 TACC1O75410 805 aa15.22■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 SERPING1P05155 500 aa15.22■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 BMP3P12645 472 aa15.22■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 MCM3P25205 808 aa15.22■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 PRR16Q569H4 304 aa15.22■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP15.22■□□□□ 0.034e-6■■□□□ 13.5
ATG4C-201ENST00000317868 PDE11AQ9HCR9 933 aa15.22■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 MOCS3O95396 460 aa15.21■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP15.21■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 CCDC40Q4G0X9 1142 aa15.21■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 REEP2Q9BRK0 252 aa15.21■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 TBC1D7Q9P0N9 293 aa15.21■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 COL4A5P29400 1685 aa15.21■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 ERMNQ8TAM6 284 aa15.21■□□□□ 0.03
ATG4C-201ENST00000317868 ATP8B3O60423 1300 aa15.21■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 YDJCA8MPS7 323 aa15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 AKR1B10O60218 316 aa15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 FRMD5Q7Z6J6 570 aa15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 NELFCDQ8IXH7 590 aa15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 CAPZA3Q96KX2 299 aa15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 GH2P01242 217 aa15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 SNAP25P60880 206 aa15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 SFMBT2Q5VUG0 894 aa15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 EXOC4Q96A65 974 aa15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 OSBPL9Q96SU4 736 aa15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 PLCB1Q9NQ66 1216 aa15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 PRR12Q9ULL5 1215 aa15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 SPDYE3A6NKU9 549 aa15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 H0YIN7 160 aa15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 PDXKO00764 312 aa15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 MAGEA1P43355 309 aa15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 ADAM9Q13443 819 aa15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 SLC15A2Q16348 729 aa15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 TXLNBQ8N3L3 684 aa15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 COG1Q8WTW3 980 aa15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 DEF6Q9H4E7 631 aa15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 ASTN1O14525 1302 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 TCP1P17987 556 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 ERCC3P19447 782 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP15.19■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 NFIL3Q16649 462 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 AOC3Q16853 763 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 IQCEQ6IPM2 695 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 SFR1Q86XK3 245 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 UIMC1Q96RL1 719 aa15.19■□□□□ 0.02
ATG4C-201ENST00000317868 TLR10Q9BXR5 811 aa15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms