RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298282.13

PKNOX2-201, Transcript of PBX/knotted 1 homeobox 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKNOX2, Length 3,687 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2-201ENST00000298282 FCER1AP12319 257 aa11.76□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 KRT9P35527 623 aa11.76□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 EIF6P56537 245 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 SNX1Q13596 522 aa11.76□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 FKBP15Q5T1M5 1219 aa11.76□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 SLFN13Q68D06 897 aa11.76□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 PLIN2Q99541 437 aa11.76□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 VPS33BQ9H267 617 aa11.76□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa11.76□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 KLHL33A6NCF5 533 aa11.76□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 OPLAHO14841 1288 aa11.76□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP11.76□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 MARSP56192 900 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 SPIRE1Q08AE8 756 aa11.76□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 GRIK3Q13003 919 aa11.76□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 PDCLQ13371 301 aa11.76□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 ECM1Q16610 540 aa11.76□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 UBE2SQ16763 222 aa11.76□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 TLDC1Q6P9B6 456 aa11.76□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 KCTD1Q719H9 257 aa11.76□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 CPLX3Q8WVH0 158 aa11.76□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 VEZTQ9HBM0 779 aa11.76□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa11.76□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 G3V3G9 751 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 AP1G2O75843 785 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 CYP3A4P08684 503 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 DCAF8Q5TAQ9 597 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 LRRC55Q6ZSA7 311 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 KCNK18Q7Z418 384 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 SLFN12Q8IYM2 578 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 ETNPPLQ8TBG4 499 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 PARD3BQ8TEW8 1205 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 ARL8AQ96BM9 186 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 MMS19Q96T76 1030 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 GMLQ99445 158 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 PLA2G6O60733 806 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 RASSF9O75901 435 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 FOSP01100 380 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 ZBED6P86452 979 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 ACCSLQ4AC99 568 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 TTMPQ5BVD1 217 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 SH2D3CQ8N5H7 860 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 SNX29Q8TEQ0 813 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 EDEM3Q9BZQ6 932 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 SIK3Q9Y2K2 1263 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 POTEMA6NI47 508 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 ERLIN1O75477 346 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 FSBPO95073 299 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 SLC16A2P36021 539 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 SREBF1P36956 1147 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 TNNI2P48788 182 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 CCDC96Q2M329 555 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 WDR93Q6P2C0 686 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 KIAA0825Q8IV33 1275 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 CCDC170Q8IYT3 715 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 COG1Q8WTW3 980 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 ANO3Q9BYT9 981 aa11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 YDJCA8MPS7 323 aa11.74□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 F5H6K3 240 aa11.74□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 NDUFA10O95299 355 aa11.74□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP11.74□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 SLC1A4P43007 532 aa11.74□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 KLRC3Q07444 240 aa11.74□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 E2F5Q15329 346 aa11.74□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 FKBP1CQ5VVH2 108 aa11.74□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 DDX12PQ92771 950 aa11.74□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 LENG9Q96B70 501 aa11.74□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 PCDHA12Q9UN75 941 aa11.74□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 COL4A5P29400 1685 aa11.74□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 KIF5CO60282 957 aa11.74□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 LCA5LO95447 670 aa11.74□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 ICA1Q05084 483 aa11.74□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 ABCB5Q2M3G0 1257 aa11.74□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 CEP112Q8N8E3 955 aa11.74□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 MTMR14Q8NCE2 650 aa11.74□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 PSMD1Q99460 953 aa11.74□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 SH3GL2Q99962 352 aa11.74□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 AMNQ9BXJ7 453 aa11.74□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 CAPS2Q9BXY5 557 aa11.74□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 DEFB129Q9H1M3 183 aa11.74□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 KLC4Q9NSK0 619 aa11.74□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa11.74□□□□□ -0.53
PKNOX2-201ENST00000298282 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms