RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282999.7

SRP19-201, Transcript of signal recognition particle 19, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SRP19, Length 937 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP19-201ENST00000282999 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 HIC1Q14526 733 aa18.5■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 CEP55Q53EZ4 464 aa18.5■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 CNKSR3Q6P9H4 555 aa18.5■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 TRIM50Q86XT4 487 aa18.5■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 RNPEPQ9H4A4 650 aa18.5■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 SLC28A3Q9HAS3 691 aa18.5■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 C6orf50Q9HD87 102 aa18.5■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 KCNH7Q9NS40 1196 aa18.5■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 SCN5AQ14524 2016 aa18.5■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 NFASCO94856 1347 aa18.49■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 EMSYQ7Z589 1322 aa18.49■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 FOSL2P15408 326 aa18.49■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 GNA11P29992 359 aa18.49■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 GRIN2CQ14957 1233 aa18.49■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 NTRK3Q16288 839 aa18.49■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 PKN1Q16512 942 aa18.49■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 ZNF618Q5T7W0 954 aa18.49■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 NIPA1Q7RTP0 329 aa18.49■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 CCDC148Q8NFR7 591 aa18.49■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 WNT8BQ93098 351 aa18.49■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 PGBD1Q96JS3 809 aa18.49■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 SDF4Q9BRK5 362 aa18.49■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 TMEM260Q9NX78 707 aa18.49■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 ERAP1Q9NZ08 941 aa18.49■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 PKD2L1Q9P0L9 805 aa18.49■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 NRCAMQ92823 1304 aa18.49■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 DOCK5Q9H7D0 1870 aa18.48■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 NBNO60934 754 aa18.48■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 EFCAB14O75071 495 aa18.48■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 THPOP40225 353 aa18.48■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 KCNJ6P48051 423 aa18.48■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 ARHGAP4P98171 946 aa18.48■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 GPNMBQ14956 572 aa18.48■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 TRAF7Q6Q0C0 670 aa18.48■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 BICD2Q8TD16 824 aa18.48■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 PHKBQ93100 1093 aa18.48■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa18.48■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa18.48■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 SLC9A2Q9UBY0 812 aa18.48■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 TELO2Q9Y4R8 837 aa18.48■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa18.47■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa18.47■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 RSPH10B2B2RC85 870 aa18.47■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 MEIS1O00470 390 aa18.47■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 TREHO43280 583 aa18.47■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 RSPH10BP0C881 870 aa18.47■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 ZNF76P36508 570 aa18.47■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 CCT2P78371 535 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa18.47■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 TRIM22Q8IYM9 498 aa18.47■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 GLG1Q92896 1179 aa18.47■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 SLC26A6Q9BXS9 759 aa18.47■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 SH3GLB2Q9NR46 395 aa18.47■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 SETD4Q9NVD3 440 aa18.47■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 KIF28PB7ZC32 967 aa18.46■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 CYP3A4P08684 503 aa18.46■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 RABGGTBP53611 331 aa18.46■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 ADAM17P78536 824 aa18.46■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 PPP2R2DQ66LE6 453 aa18.46■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 CYP2W1Q8TAV3 490 aa18.46■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 LMBR1Q8WVP7 490 aa18.46■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 AZI2Q9H6S1 392 aa18.46■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 PDRG1Q9NUG6 133 aa18.46■□□□□ 0.55
SRP19-201ENST00000282999 CPLX1O14810 134 aa18.45■□□□□ 0.54
SRP19-201ENST00000282999 LGR5O75473 907 aa18.45■□□□□ 0.54
SRP19-201ENST00000282999 ARP10275 920 aa18.45■□□□□ 0.54
SRP19-201ENST00000282999 ANAPC15P60006 121 aa18.45■□□□□ 0.54
SRP19-201ENST00000282999 WDR5P61964 334 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
SRP19-201ENST00000282999 SETQ01105 290 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
SRP19-201ENST00000282999 IKBKEQ14164 716 aa18.45■□□□□ 0.54
SRP19-201ENST00000282999 TAF2Q6P1X5 1199 aa18.45■□□□□ 0.54
SRP19-201ENST00000282999 HERC6Q8IVU3 1022 aa18.45■□□□□ 0.54
SRP19-201ENST00000282999 CRYGNQ8WXF5 182 aa18.45■□□□□ 0.54
SRP19-201ENST00000282999 COL6A3P12111 3177 aa18.45■□□□□ 0.54
SRP19-201ENST00000282999 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
SRP19-201ENST00000282999 GBF1Q92538 1859 aa18.44■□□□□ 0.54
SRP19-201ENST00000282999 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
SRP19-201ENST00000282999 ACTR2P61160 394 aa18.44■□□□□ 0.54
SRP19-201ENST00000282999 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
SRP19-201ENST00000282999 PPFIA1Q13136 1202 aa18.44■□□□□ 0.54
SRP19-201ENST00000282999 MBTPS1Q14703 1052 aa18.44■□□□□ 0.54
SRP19-201ENST00000282999 PLA2G4DQ86XP0 818 aa18.44■□□□□ 0.54
SRP19-201ENST00000282999 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms