RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269228.9

NPC1-201, Transcript of NPC intracellular cholesterol transporter 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NPC1, Length 5,157 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1-201ENST00000269228 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.96□□□□□ -0.01
NPC1-201ENST00000269228 MYOZ2Q9NPC6 264 aa14.96□□□□□ -0.01
NPC1-201ENST00000269228 COX16Q9P0S2 106 aa14.96□□□□□ -0.01
NPC1-201ENST00000269228 GCNT4Q9P109 453 aa14.96□□□□□ -0.01
NPC1-201ENST00000269228 GRIN3BO60391 1043 aa14.96□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 IGSF3O75054 1194 aa14.96□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 FCER1AP12319 257 aa14.96□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 RASSF7Q02833 373 aa14.96□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 ELF2Q15723 593 aa14.96□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 CCDC89Q8N998 374 aa14.96□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.96□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 MIS12Q9H081 205 aa14.96□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 POLLQ9UGP5 575 aa14.96□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 FDX1P10109 184 aa14.95□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 RASA1P20936 1047 aa14.95□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 ABCD1P33897 745 aa14.95□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 SLC10A5Q5PT55 438 aa14.95□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 PADI6Q6TGC4 694 aa14.95□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 THAP12O43422 761 aa14.95□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 MSTO1Q9BUK6 570 aa14.95□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 SERPINA10Q9UK55 444 aa14.95□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 PP2D1A8MPX8 630 aa14.95□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 KIF28PB7ZC32 967 aa14.95□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 ZBTB16Q05516 673 aa14.95□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 CLUL1Q15846 466 aa14.95□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 CEP128Q6ZU80 1094 aa14.95□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 C16orf86Q6ZW13 317 aa14.95□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 SPZ1Q9BXG8 430 aa14.95□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa14.95□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 COG2Q14746 738 aa14.95□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 BSPRYQ5W0U4 402 aa14.95□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 CASC4Q6P4E1 433 aa14.95□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 UNC13DQ70J99 1090 aa14.95□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 CATSPER4Q7RTX7 472 aa14.95□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 SFR1Q86XK3 245 aa14.95□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 THNSL1Q8IYQ7 743 aa14.95□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 NEDD9Q14511 834 aa14.94□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 SWSAP1Q6NVH7 229 aa14.94□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa14.94□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 HYOU1Q9Y4L1 999 aa14.94□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 RNF8O76064 485 aa14.94□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 TTLL4Q14679 1199 aa14.94□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 TRIM50Q86XT4 487 aa14.94□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 THAP9Q9H5L6 903 aa14.94□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 NYAP2Q9P242 653 aa14.94□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 POTEFA5A3E0 1075 aa14.94□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 POTEIP0CG38 1075 aa14.94□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 LRRC63Q05C16 580 aa14.94□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 ALCAMQ13740 583 aa14.94□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 POTEGQ6S5H5 508 aa14.94□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 POTEEQ6S8J3 1075 aa14.94□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.94□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 FAM167AQ96KS9 214 aa14.94□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 SNX25Q9H3E2 840 aa14.94□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 GABBR1Q9UBS5 961 aa14.94□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 GFPT2O94808 682 aa14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 ATP1A3P13637 1013 aa14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 LMNB1P20700 586 aa14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 HPDP32754 393 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 C7orf31Q8N865 590 aa14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 FAM133AQ8N9E0 248 aa14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 ZNF280CQ8ND82 737 aa14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 TCP11Q8WWU5 503 aa14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 RAD54LQ92698 747 aa14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 DEFB129Q9H1M3 183 aa14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 KRIT1O00522 736 aa14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 NDST4Q9H3R1 872 aa14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 ARHGAP23Q9P227 1491 aa14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 CAPN2P17655 700 aa14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 CD58P19256 250 aa14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 QARSP47897 775 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 MXRA7P84157 204 aa14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 MESDQ14696 234 aa14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.022e-7■■■□□ 15.8
NPC1-201ENST00000269228 FAM149B1Q96BN6 582 aa14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 ZNF302Q9NR11 478 aa14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 ZNF233A6NK53 670 aa14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 ETF1P62495 437 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 GABPAQ06546 454 aa14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 PAK2Q13177 524 aa14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 RSAD2Q8WXG1 361 aa14.93□□□□□ -0.02
NPC1-201ENST00000269228 IL25Q9H293 177 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms