RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 CCDC122Q5T0U0 273 aa24.01■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 MIPOL1Q8TD10 442 aa24.01■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 HINFPQ9BQA5 517 aa24.01■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 NMT2O60551 498 aa24.01■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 ATP2B4P23634 1241 aa24.01■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 DBN1Q16643 649 aa24.01■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 CCDC178Q5BJE1 867 aa24.01■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.01■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 SPON1Q9HCB6 807 aa24.01■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 KCNH3Q9ULD8 1083 aa24.01■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 LAMB1P07942 1786 aa24■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 A0A1B0GVG6 124 aa24■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 LBRQ14739 615 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 SPATA1Q5VX52 437 aa24■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 C2CD2Q9Y426 696 aa24■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 N4BP3O15049 544 aa24■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 KIAA0753Q2KHM9 967 aa24■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 FAM47AQ5JRC9 791 aa24■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa24■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa24■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa24■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 CREG2Q8IUH2 290 aa24■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 TRIM42Q8IWZ5 723 aa24■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 FAM167BQ9BTA0 163 aa24■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 MCM9Q9NXL9 1143 aa24■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 MYH8P13535 1937 aa23.99■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 POSTNQ15063 836 aa23.99■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa23.99■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 CDKAL1Q5VV42 579 aa23.99■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 TMBIM4Q9HC24 238 aa23.99■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 IL1R1P14778 569 aa23.99■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 SBK1Q52WX2 424 aa23.99■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 HAUS3Q68CZ6 603 aa23.99■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 TTLL6Q8N841 843 aa23.99■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 SPATA4Q8NEY3 305 aa23.99■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 FOXN1O15353 648 aa23.98■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 KRT86O43790 486 aa23.98■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 ORC4O43929 436 aa23.98■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 ZBED6P86452 979 aa23.98■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 SEPT2Q15019 361 aa23.98■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 TMC4Q7Z404 712 aa23.98■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 KCNJ14Q9UNX9 436 aa23.98■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 CREB3O43889 395 aa23.98■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 RCAN1P53805 252 aa23.98■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 SLC7A5Q01650 507 aa23.98■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 PTPAQ15257 358 aa23.98■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 MAF1Q9H063 256 aa23.98■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.98■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 RIMBP2O15034 1052 aa23.97■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 PCP11498 1178 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 HERVK_113P62684 666 aa23.97■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.97■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 LTBP1Q14766 1721 aa23.97■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 LRRC37AA6NMS7 1700 aa23.97■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 IDEP14735 1019 aa23.96■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 SHISA4Q96DD7 197 aa23.96■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 PIDD1Q9HB75 910 aa23.96■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 JADE2Q9NQC1 790 aa23.96■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 CEP131Q9UPN4 1083 aa23.96■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 HPDP32754 393 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 GNAQP50148 359 aa23.96■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 TGFB2P61812 414 aa23.96■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 TROAPQ12815 778 aa23.96■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 TRIM29Q14134 588 aa23.96■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 DYNLL2Q96FJ2 89 aa23.96■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa23.96■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 SNX12Q9UMY4 172 aa23.96■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 DLEC1Q9Y238 1755 aa23.96■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 KRT83P78385 493 aa23.95■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 MYBPC3Q14896 1274 aa23.95■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 TAF11Q15544 211 aa23.95■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 IFT20Q8IY31 132 aa23.95■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 TRIM22Q8IYM9 498 aa23.95■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.95■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 CHP1Q99653 195 aa23.95■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 BTBD18B2RXH4 712 aa23.95■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 PLEKHA8P1O95397 391 aa23.95■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 OATP04181 439 aa23.95■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 PRLRP16471 622 aa23.95■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 DRD4P21917 467 aa23.95■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 KRT9P35527 623 aa23.95■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 FUT2Q10981 343 aa23.95■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 C12orf60Q5U649 245 aa23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms