RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 TNNC1P63316 161 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 EXOC3L4Q17RC7 722 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 RDH13Q8NBN7 331 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 SAMM50Q9Y512 469 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 PAK2Q13177 524 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 PROM2Q8N271 834 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 TSKSQ9UJT2 592 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 SHANK3Q9BYB0 1731 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 FAM13AO94988 1023 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 MAEAQ7L5Y9 396 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 TPH2Q8IWU9 490 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 PACSIN1Q9BY11 444 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 SALL4Q9UJQ4 1053 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 NDUFAB1O14561 156 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 USP8P40818 1118 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 UBXN2AP68543 259 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 CDK17Q00537 523 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 AP1M1Q9BXS5 423 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 A0A087X0T9 212 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 KIAA0754O94854 1291 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 FAM228BP0C875 321 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 EPB41P11171 864 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 SFR1Q86XK3 245 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 SH2D3CQ8N5H7 860 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 PKD2L1Q9P0L9 805 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 CFBP00751 764 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 CARSP49589 748 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 NFIAQ12857 509 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 LRRC55Q6ZSA7 311 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 MYCT1Q8N699 235 aa20.24■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 SLC9A1P19634 815 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 ABCB4P21439 1286 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 KRT14P02533 472 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 SMARCA1P28370 1054 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 ICA1Q05084 483 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 SYCP3Q8IZU3 236 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 HAS1Q92839 578 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 GOPCQ9HD26 462 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 DOT1LQ8TEK3 1739 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 LRP5O75197 1615 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 RPL13P26373 211 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 MMGT1Q8N4V1 131 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 PIGOQ8TEQ8 1089 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 TLR10Q9BXR5 811 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 SWAP70Q9UH65 585 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 CACNA1SQ13698 1873 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.23■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 AGPSO00116 658 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 PPFIA4O75335 1185 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 KCNMA1Q12791 1236 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 PDCLQ13371 301 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 NAA35Q5VZE5 725 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 PEX26Q7Z412 305 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 SEPT2Q15019 361 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 BAP1Q92560 729 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 GOLGA8KD6RF30 607 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 ARHGAP4P98171 946 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 SLFN12Q8IYM2 578 aa20.22■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa20.21■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 IL1R1P14778 569 aa20.21■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 NNTQ13423 1086 aa20.21■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 CEP85LQ5SZL2 805 aa20.21■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa20.21■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 SLC30A10Q6XR72 485 aa20.21■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 DAAM2Q86T65 1068 aa20.21■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 FBXO11Q86XK2 927 aa20.21■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 MED24O75448 989 aa20.21■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 FLOT1O75955 427 aa20.21■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 AFPP02771 609 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 MAGEA9P43362 315 aa20.21■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 EMBQ6PCB8 327 aa20.21■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 CEP63Q96MT8 703 aa20.21■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 CYP2J2P51589 502 aa20.21■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 SLC18A3Q16572 532 aa20.21■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms