RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM10	YOL093W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YLR413W	Q06689	675 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	COS7	Q07788	383 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YPR202W	Q08993	238 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	GET4	Q12125	312 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	UPC2	Q12151	913 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	SUL2	Q12325	893 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	YSR3	P23501	404 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	SED4	P25365	1065 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	OCA4	P25366	362 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	SIN4	P32259	974 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	PET127	P32606	800 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	SDH3	P33421	198 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	YEL073C	P39974	107 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	AYR1	P40471	297 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	MEP2	P41948	499 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	ALR2	P43553	858 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	GAT1	P43574	510 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	YJL049W	P47048	450 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	TIS11	P47977	285 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	SDT1	P53078	280 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	GOR1	P53839	350 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	HSP31	Q04432	237 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	PSR1	Q07800	427 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	MUM3	Q08750	479 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	MCH5	Q08777	521 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	RUP1	Q12242	671 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	RGT2	Q12300	763 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	SPT3	P06844	337 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	MSS18	P08593	268 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	RED1	P14291	827 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	HXT4	P32467	576 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	REC104	P33323	182 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	PTC1	P35182	281 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	FTH1	P38310	465 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	AXL2	P38928	823 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	HXT7	P39004	570 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	IMA5	P40884	581 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	GAS3	Q03655	524 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	YET2	Q04210	160 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	GAD1	Q04792	585 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	YML053C	Q04978	212 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	GMC2	Q06201	188 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	YEH2	Q07950	538 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	OSW1	Q08692	278 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	SRO7	Q12038	1033 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	NMD4	Q12129	218 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	PST1	Q12355	444 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	PHO5	P00635	467 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	MRP13	P12686	339 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	TOP3	P13099	656 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	CCA1	P21269	546 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	TY2A-C	P25383	438 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	CIN8	P27895	1000 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	RML2	P32611	393 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	AFR1	P33304	620 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	MRPL37	P36532	105 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	YBR071W	P38243	211 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	IST2	P38250	946 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	YHR112C	P38716	378 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	ELO1	P39540	310 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	FMP32	P43557	207 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	MET31	Q03081	177 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRM10	YOL093W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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