RNA–Protein interactions for RNA: YNL298W

CLA4, Transcript of Cdc42p-activated signal transducing kinase, yeast

Gene CLA4, Length 2,529 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLA4	YNL298W	AIM22	P47051	409 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	DIA3	P52290	468 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	RTC4	P53850	401 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	SLG1	P54867	378 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	FAR8	Q05040	523 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	ECI1	Q05871	280 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	MDM30	Q05930	598 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	POM152	P39685	1337 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	DAL81	P21657	970 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	FZO1	P38297	855 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	SWC5	P38326	303 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	YHR210C	P38893	341 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	UIP3	P39547	235 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	MPS3	P47069	682 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	MRK1	P50873	501 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	ARO80	Q04052	950 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	OSW1	Q08692	278 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	TIP41	Q12199	356 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	INP53	Q12271	1107 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	NCA2	Q12374	616 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	TRM11	Q12463	433 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	YPR089W	O13585	888 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	SUA5	P32579	426 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	TAE1	P38340	232 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	TDA10	P42938	290 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	BRO1	P48582	844 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	SSY1	Q03770	852 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	AHC1	Q12433	566 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLA4	YNL298W	HIS5	P07172	385 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	ERG11	P10614	530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	GSH1	P32477	678 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	GPI16	P38875	610 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	ECM10	P39987	644 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	CSM2	P40465	213 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	YFR020W	P43600	232 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	FAR3	P46671	204 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	SRL4	Q03085	281 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	CYK3	Q07533	885 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	MED2	Q12124	431 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	PUT2	P07275	575 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	YKR015C	P36111	568 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	ECM4	P36156	370 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	YER085C	P40058	173 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	RPC17	P47076	161 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	KAP114	P53067	1004 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	YGR126W	P53274	230 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	CAB5	Q03941	241 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	RRG8	Q06109	277 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	OCA6	Q12454	224 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	AI3	P03877	415 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	SKN7	P38889	622 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	ROG1	P53118	685 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	PGA2	P53903	129 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	PET117	Q02771	107 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	ORM2	Q06144	216 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	POS5	Q06892	414 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
CLA4	YNL298W	NPC2	Q12408	173 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	MAK31	P23059	88 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	MYO3	P36006	1272 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	ELF1	P36053	145 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	YHR045W	P38775	560 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	ICP55	P40051	511 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	YGL108C	P53139	140 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	PNG1	Q02890	363 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	RSN1	Q03516	953 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	IPK1	Q06667	281 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	TRM13	Q12383	476 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	SEY1	Q99287	776 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLA4	YNL298W	RIP1	P08067	215 aa		4.94	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.3 ms