RNA–Protein interactions for RNA: YJL034W

KAR2, Transcript of ATPase involved in protein import into the ER, yeast

Gene KAR2, Length 2,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KAR2	YJL034W	ERV46	P39727	415 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	YFR018C	P43599	363 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	YJR149W	P47177	404 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	EMC4	P53073	190 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	YGR015C	P53208	328 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	YNL034W	P53963	612 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	DID2	P69771	204 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	SNF8	Q12483	233 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	MDM12	Q92328	271 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	HIP1	P06775	603 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	SIR1	P21691	654 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	DBF2	P22204	572 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	RSC6	P25632	483 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	NTG1	P31378	399 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	ATP11	P32453	318 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	SOL2	P37262	315 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	YBR071W	P38243	211 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	IML3	P38265	245 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	GIC1	P38785	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
KAR2	YJL034W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	CEM1	P39525	442 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	MIT1	P40002	666 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	MOB1	P40484	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	AIM22	P47051	409 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	BIR1	P47134	954 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	RSM7	P47150	247 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	VEL1	P53058	206 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	HST3	P53687	447 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	MRPL50	P53724	139 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	GOR1	P53839	350 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	YNL140C	P53910	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	TGL2	P54857	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	PML39	Q03760	334 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	EMI1	Q04406	187 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	THP1	Q08231	455 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	TPK3	P05986	398 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	KAR1	P11927	433 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	UNG1	P12887	359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	GAL3	P13045	520 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	RED1	P14291	827 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	YJU3	P28321	313 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	SEC17	P32602	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	STE5	P32917	917 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	SEA4	P38164	1038 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	RCK1	P38622	512 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	JLP2	P40206	208 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	YJR030C	P47101	745 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	YJR098C	P47139	656 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	GPI8	P49018	411 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	BIO3	P50277	480 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	YNR065C	P53751	1116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	TMN2	Q04562	672 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	DXO1	Q06349	442 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
KAR2	YJL034W	YOL131W	Q08270	108 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	YPR011C	Q12251	326 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	ATG31	Q12421	196 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	HXT4	P32467	576 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	MRPL6	P32904	214 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	DCW1	P36091	449 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	GMH1	P36125	273 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	COS111	P38308	924 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	YAR028W	P39548	234 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	GRX5	Q02784	150 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	RRN5	Q02983	363 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	BSC2	Q05611	235 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	MLC2	Q06580	163 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	MDM36	Q06820	579 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	NMD4	Q12129	218 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	RGT2	Q12300	763 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	MED11	Q99278	115 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	GRR1	P24814	1151 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	PPZ1	P26570	692 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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