RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	NSI1	Q12457	570 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	FCY2	P17064	533 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	STP22	P25604	385 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YCR099C	P25657	155 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	COT1	P32798	439 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	VPS17	P32913	551 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	REG2	P38232	338 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	EMC5	P40540	141 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	POL31	P46957	487 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SKG3	Q06315	1026 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PMT7	Q06644	662 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	GRC3	Q07845	632 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YOR019W	Q99248	730 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CDC4	P07834	779 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	BAS1	P22035	811 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	EMC3	P36039	253 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	EDS1	P38073	919 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MNN5	P46982	586 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	AIM14	P53109	570 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	GIS1	Q03833	894 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RRN11	Q04712	507 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	TRM13	Q12383	476 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	COX3	P00420	269 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	GCR1	P07261	785 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CMP2	P14747	604 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MRM1	P25270	412 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	TIR2	P33890	251 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	BIM1	P40013	344 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	FCY21	P40039	528 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ROG3	P43602	733 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ZRG17	P53735	605 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SRF1	Q12516	437 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CTT1	P06115	562 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CLN1	P20437	546 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	GLC3	P32775	704 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	NSG1	P38837	291 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CCC1	P47818	322 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YGR066C	P53242	292 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	TIM13	P53299	105 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RIM13	Q03792	727 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	BSP1	Q06604	576 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	FRE5	Q08908	694 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	POM33	Q12164	279 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	VPS15	P22219	1454 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MDM35	O60200	86 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ARO7	P32178	256 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	GSH1	P32477	678 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YHK8	P38776	514 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	TAF4	P50105	388 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	HHT1	P61830	136 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RRG8	Q06109	277 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ACF2	Q12168	779 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	UTR1	P21373	530 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CSG2	P35206	410 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PHO11	P35842	467 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MRPL15	P36523	253 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ALG8	P40351	577 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	FET5	P43561	622 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YDR132C	Q03900	495 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	FIT1	Q04433	528 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YEH1	Q07804	573 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	OPI10	Q08202	246 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MDY2	Q12285	212 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PCC1	Q3E833	88 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	AUS1	Q08409	1394 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	AI4	P03878	556 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	COR1	P07256	457 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SPO11	P23179	398 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MTC2	P34246	357 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	APN2	P38207	520 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	STB1	P42845	420 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	COQ5	P49017	307 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YGL138C	P53122	345 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ALG12	P53730	551 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	VPS28	Q02767	242 aa		2.68	□□□□□ -1.98

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