RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638817.1

PARL-211, Transcript of presenilin associated rhomboid like, humanhuman

TSL 5

Gene PARL, Length 1,534 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARL-211ENST00000638817 MYL10Q9BUA6 226 aa23.54■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 USP26Q9BXU7 913 aa23.54■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 BCAS3Q9H6U6 928 aa23.54■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 NOP56O00567 594 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 LGR5O75473 907 aa23.54■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 GJB5O95377 273 aa23.54■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 PCNX4Q63HM2 1172 aa23.54■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 ZBED2Q9BTP6 218 aa23.54■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
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PARL-211ENST00000638817 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa23.53■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa23.53■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 LIFRP42702 1097 aa23.53■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa23.53■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.53■■□□□ 1.36
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PARL-211ENST00000638817 GPR20Q99678 358 aa23.53■■□□□ 1.36
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PARL-211ENST00000638817 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.53■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 MICAL3Q7RTP6 2002 aa23.52■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 LCHNA4D1U4 455 aa23.52■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 CCDC69A6NI79 296 aa23.52■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 RSPH10B2B2RC85 870 aa23.52■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 RSPH10BP0C881 870 aa23.52■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 CALM1P0DP23 149 aa23.52■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 CALM2P0DP24 149 aa23.52■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 CALM3P0DP25 149 aa23.52■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 THPOP40225 353 aa23.52■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 AAK1Q2M2I8 961 aa23.52■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 USP17L6PQ6QN14 398 aa23.52■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 CYFIP1Q7L576 1253 aa23.52■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 IL27Q8NEV9 243 aa23.52■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 RNPEPQ9H4A4 650 aa23.52■■□□□ 1.36
PARL-211ENST00000638817 CAND2O75155 1236 aa23.51■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 PLEKHA8P1O95397 391 aa23.51■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 GRB10Q13322 594 aa23.51■■□□□ 1.35
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PARL-211ENST00000638817 NFXL1Q6ZNB6 911 aa23.51■■□□□ 1.35
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PARL-211ENST00000638817 SLC27A2O14975 620 aa23.5■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 LPXNO60711 386 aa23.5■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 SPRED2Q7Z698 418 aa23.5■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 NLRX1Q86UT6 975 aa23.5■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 LMCD1Q9NZU5 365 aa23.5■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 SIP14410 1827 aa23.5■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 TREHO43280 583 aa23.49■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 GNAT1P11488 350 aa23.49■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 NECTIN1Q15223 517 aa23.49■■□□□ 1.35
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PARL-211ENST00000638817 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
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PARL-211ENST00000638817 BMP1P13497 986 aa23.49■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa23.49■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 CREB3L3Q68CJ9 461 aa23.49■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 KRT40Q6A162 431 aa23.49■■□□□ 1.35
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PARL-211ENST00000638817 REV3LO60673 3130 aa23.48■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 ERVK-21P61565 698 aa23.48■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 ADAM17P78536 824 aa23.48■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 CDHR1Q96JP9 859 aa23.48■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
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PARL-211ENST00000638817 AMHP03971 560 aa23.47■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 TFF2Q03403 129 aa23.47■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 PSTPIP2Q9H939 334 aa23.47■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 INSL6Q9Y581 213 aa23.47■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.47■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 RXRAP19793 462 aa23.46■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 SGMS1Q86VZ5 419 aa23.46■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 TRIM50Q86XT4 487 aa23.46■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 SETD4Q9NVD3 440 aa23.46■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 TELO2Q9Y4R8 837 aa23.46■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PARL-211ENST00000638817 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PARL-211ENST00000638817 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PARL-211ENST00000638817 TMTC3Q6ZXV5 915 aa23.45■■□□□ 1.34
PARL-211ENST00000638817 FANCBQ8NB91 859 aa23.45■■□□□ 1.34
PARL-211ENST00000638817 GDPD5Q8WTR4 605 aa23.45■■□□□ 1.34
PARL-211ENST00000638817 SEPT8Q92599 483 aa23.45■■□□□ 1.34
PARL-211ENST00000638817 KAT6AQ92794 2004 aa23.45■■□□□ 1.34
PARL-211ENST00000638817 ANO2Q9NQ90 1003 aa23.45■■□□□ 1.34
PARL-211ENST00000638817 NRCAMQ92823 1304 aa23.44■■□□□ 1.34
PARL-211ENST00000638817 KCNA2P16389 499 aa23.44■■□□□ 1.34
PARL-211ENST00000638817 FAM26DQ5JW98 314 aa23.44■■□□□ 1.34
PARL-211ENST00000638817 SUGCTQ9HAC7 445 aa23.44■■□□□ 1.34
PARL-211ENST00000638817 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa23.44■■□□□ 1.34
PARL-211ENST00000638817 MUC3AQ02505 3323 aa23.44■■□□□ 1.34
PARL-211ENST00000638817 FAM117BQ6P1L5 589 aa23.43■■□□□ 1.34
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