RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620026.1

TULP4-207, Transcript of tubby like protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene TULP4, Length 680 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4-207ENST00000620026 C6orf50Q9HD87 102 aa24.23■■□□□ 1.47
TULP4-207ENST00000620026 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa24.23■■□□□ 1.47
TULP4-207ENST00000620026 MYH7BA7E2Y1 1941 aa24.23■■□□□ 1.47
TULP4-207ENST00000620026 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
TULP4-207ENST00000620026 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
TULP4-207ENST00000620026 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
TULP4-207ENST00000620026 LGALS2P05162 132 aa24.22■■□□□ 1.47
TULP4-207ENST00000620026 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
TULP4-207ENST00000620026 OTOP2Q7RTS6 562 aa24.22■■□□□ 1.47
TULP4-207ENST00000620026 ANO3Q9BYT9 981 aa24.22■■□□□ 1.47
TULP4-207ENST00000620026 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
TULP4-207ENST00000620026 ZBBXA8MT70 800 aa24.21■■□□□ 1.47
TULP4-207ENST00000620026 H3BRB1 525 aa24.21■■□□□ 1.47
TULP4-207ENST00000620026 PITPNM1O00562 1244 aa24.21■■□□□ 1.47
TULP4-207ENST00000620026 ITGB5P18084 799 aa24.21■■□□□ 1.47
TULP4-207ENST00000620026 AP3B2Q13367 1082 aa24.21■■□□□ 1.47
TULP4-207ENST00000620026 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
TULP4-207ENST00000620026 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa24.21■■□□□ 1.47
TULP4-207ENST00000620026 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
TULP4-207ENST00000620026 TRIM22Q8IYM9 498 aa24.21■■□□□ 1.47
TULP4-207ENST00000620026 CAGE1Q8TC20 777 aa24.21■■□□□ 1.47
TULP4-207ENST00000620026 GPR20Q99678 358 aa24.21■■□□□ 1.47
TULP4-207ENST00000620026 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
TULP4-207ENST00000620026 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.47
TULP4-207ENST00000620026 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
TULP4-207ENST00000620026 JADE2Q9NQC1 790 aa24.21■■□□□ 1.47
TULP4-207ENST00000620026 TMEM260Q9NX78 707 aa24.21■■□□□ 1.47
TULP4-207ENST00000620026 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa24.21■■□□□ 1.47
TULP4-207ENST00000620026 NID2Q14112 1375 aa24.2■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 HAS3O00219 553 aa24.2■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 MAFGO15525 162 aa24.2■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 RFC2P35250 354 aa24.2■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 STK3Q13188 491 aa24.2■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 C16orf70Q9BSU1 422 aa24.2■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 PFKMP08237 780 aa24.19■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 ACTN1P12814 892 aa24.19■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 IFNAR1P17181 557 aa24.19■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 GNA11P29992 359 aa24.19■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 CCDC148Q8NFR7 591 aa24.19■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 HERVK_113Q902F9 699 aa24.19■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 MXRA8Q9BRK3 442 aa24.19■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 C17orf102A2RUQ5 167 aa24.18■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 ATP9AO75110 1047 aa24.18■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 IQCF3P0C7M6 154 aa24.18■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 EVCP57679 992 aa24.18■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 MCTP2Q6DN12 878 aa24.18■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 BICD2Q8TD16 824 aa24.18■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 AFAP1L1Q8TED9 768 aa24.18■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 SDF4Q9BRK5 362 aa24.18■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 MTMR10Q9NXD2 777 aa24.18■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 KCNA2P16389 499 aa24.17■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 PTK7Q13308 1070 aa24.17■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 PKN1Q16512 942 aa24.17■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 CEP55Q53EZ4 464 aa24.17■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 ATP6V0A1Q93050 837 aa24.17■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa24.17■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 ESYT2A0FGR8 921 aa24.16■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa24.16■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa24.16■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 GNAT1P11488 350 aa24.16■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 SELPP16109 830 aa24.16■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 SREBF1P36956 1147 aa24.16■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 ANAPC15P60006 121 aa24.16■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 ARHGAP4P98171 946 aa24.16■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 NTRK3Q16288 839 aa24.16■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 LRRC8DQ7L1W4 858 aa24.16■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 TRIM50Q86XT4 487 aa24.16■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 SEPT1Q8WYJ6 367 aa24.16■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 GLG1Q92896 1179 aa24.16■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 ZMYND12Q9H0C1 365 aa24.16■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 KCNH7Q9NS40 1196 aa24.16■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 DNAJB2P25686 324 aa24.15■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 CLK2P49760 499 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 NLRP5P59047 1200 aa24.15■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 CYP2W1Q8TAV3 490 aa24.15■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 VPS54Q9P1Q0 977 aa24.15■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 MSRAQ9UJ68 235 aa24.15■■□□□ 1.46
TULP4-207ENST00000620026 GRXCR1A8MXD5 290 aa24.14■■□□□ 1.45
TULP4-207ENST00000620026 CKBP12277 381 aa24.14■■□□□ 1.45
TULP4-207ENST00000620026 RASIP1Q5U651 963 aa24.14■■□□□ 1.45
TULP4-207ENST00000620026 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
TULP4-207ENST00000620026 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
TULP4-207ENST00000620026 SEMA6BQ9H3T3 888 aa24.14■■□□□ 1.45
TULP4-207ENST00000620026 SLC9A2Q9UBY0 812 aa24.14■■□□□ 1.45
TULP4-207ENST00000620026 TELO2Q9Y4R8 837 aa24.14■■□□□ 1.45
TULP4-207ENST00000620026 CDKL5O76039 1030 aa24.13■■□□□ 1.45
TULP4-207ENST00000620026 PARNO95453 639 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
TULP4-207ENST00000620026 ARP10275 920 aa24.13■■□□□ 1.45
TULP4-207ENST00000620026 THPOP40225 353 aa24.13■■□□□ 1.45
TULP4-207ENST00000620026 ANKRD1Q15327 319 aa24.13■■□□□ 1.45
TULP4-207ENST00000620026 TIFAQ96CG3 184 aa24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms