RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 GDPD5Q8WTR4 605 aa28.82■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 ATP6V0A1Q93050 837 aa28.82■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 SUGCTQ9HAC7 445 aa28.82■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 LINC01553A4QN01 128 aa28.81■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa28.81■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 SGSM2O43147 1006 aa28.81■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa28.81■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa28.81■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 ANTXR2P58335 489 aa28.81■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP28.81■■■□□ 2.27e-8■□□□□ 9.6
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PTPRF-216ENST00000617451 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
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PTPRF-216ENST00000617451 NEDD9Q14511 834 aa28.8■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 FAM117BQ6P1L5 589 aa28.8■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 METTL7BQ6UX53 244 aa28.8■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 PIBF1Q8WXW3 757 aa28.8■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 USP26Q9BXU7 913 aa28.8■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 RNPEPQ9H4A4 650 aa28.8■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 BRWD1Q9NSI6 2320 aa28.8■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 TREHO43280 583 aa28.79■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 SEMA3FQ13275 785 aa28.79■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa28.79■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 CYFIP1Q7L576 1253 aa28.79■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 MAP4K1Q92918 833 aa28.79■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 MAP3K14Q99558 947 aa28.79■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 INSL6Q9Y581 213 aa28.79■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 FIBPO43427 364 aa28.78■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 GPR20Q99678 358 aa28.78■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 SPZ1Q9BXG8 430 aa28.78■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 RTEL1Q9NZ71 1219 aa28.78■■■□□ 2.2
PTPRF-216ENST00000617451 AMHP03971 560 aa28.77■■■□□ 2.2
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PTPRF-216ENST00000617451 MYOCDQ8IZQ8 938 aa28.76■■■□□ 2.19
PTPRF-216ENST00000617451 LY9Q9HBG7 655 aa28.76■■■□□ 2.19
PTPRF-216ENST00000617451 PIK3CDO00329 1044 aa28.75■■■□□ 2.19
PTPRF-216ENST00000617451 SMARCA1P28370 1054 aa28.75■■■□□ 2.19
PTPRF-216ENST00000617451 PCNX4Q63HM2 1172 aa28.75■■■□□ 2.19
PTPRF-216ENST00000617451 XRRA1Q6P2D8 792 aa28.75■■■□□ 2.19
PTPRF-216ENST00000617451 USP17L6PQ6QN14 398 aa28.75■■■□□ 2.19
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF654Q8IZM8 581 aa28.75■■■□□ 2.19
PTPRF-216ENST00000617451 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
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PTPRF-216ENST00000617451 SETD4Q9NVD3 440 aa28.75■■■□□ 2.19
PTPRF-216ENST00000617451 MICAL3Q7RTP6 2002 aa28.75■■■□□ 2.19
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PTPRF-216ENST00000617451 DDAH1O94760 285 aa28.74■■■□□ 2.19
PTPRF-216ENST00000617451 GNAT1P11488 350 aa28.74■■■□□ 2.19
PTPRF-216ENST00000617451 KIF5BP33176 963 aa28.74■■■□□ 2.19
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PTPRF-216ENST00000617451 SEPT8Q92599 483 aa28.74■■■□□ 2.19
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PTPRF-216ENST00000617451 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa28.74■■■□□ 2.19
PTPRF-216ENST00000617451 TELO2Q9Y4R8 837 aa28.74■■■□□ 2.19
PTPRF-216ENST00000617451 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
PTPRF-216ENST00000617451 SIP14410 1827 aa28.73■■■□□ 2.19
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM50Q86XT4 487 aa28.73■■■□□ 2.19
PTPRF-216ENST00000617451 LZTS2Q9BRK4 669 aa28.73■■■□□ 2.19
PTPRF-216ENST00000617451 MTA3Q9BTC8 594 aa28.73■■■□□ 2.19
PTPRF-216ENST00000617451 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa28.73■■■□□ 2.19
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
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PTPRF-216ENST00000617451 TOP1MTQ969P6 601 aa28.71■■■□□ 2.19
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PTPRF-216ENST00000617451 NRCAMQ92823 1304 aa28.69■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
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PTPRF-216ENST00000617451 EPC2Q52LR7 807 aa28.68■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 SAMD11Q96NU1 681 aa28.68■■■□□ 2.18
PTPRF-216ENST00000617451 YME1L1Q96TA2 773 aa28.68■■■□□ 2.18
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