RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 DSTYKQ6XUX3 929 aa21.93■■□□□ 1.1
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CTDP1-208ENST00000613122 MAN2A1Q16706 1144 aa21.92■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 NXNQ6DKJ4 435 aa21.92■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 JAK3P52333 1124 aa21.92■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 STXBP2Q15833 593 aa21.92■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 ARMCX2Q7L311 632 aa21.92■■□□□ 1.1
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CTDP1-208ENST00000613122 CD209Q9NNX6 404 aa21.92■■□□□ 1.1
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CTDP1-208ENST00000613122 MSTO1Q9BUK6 570 aa21.91■■□□□ 1.1
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CTDP1-208ENST00000613122 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 ABCC3O15438 1527 aa21.9■■□□□ 1.1
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CTDP1-208ENST00000613122 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa21.9■■□□□ 1.1
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CTDP1-208ENST00000613122 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
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CTDP1-208ENST00000613122 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
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