RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611205.4

CDKN3-211, Transcript of cyclin dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CDKN3, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3-211ENST00000611205 LGALS2P05162 132 aa28.19■■■□□ 2.1
CDKN3-211ENST00000611205 RSPH10BP0C881 870 aa28.19■■■□□ 2.1
CDKN3-211ENST00000611205 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP28.19■■■□□ 2.1
CDKN3-211ENST00000611205 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
CDKN3-211ENST00000611205 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa28.18■■■□□ 2.1
CDKN3-211ENST00000611205 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa28.18■■■□□ 2.1
CDKN3-211ENST00000611205 DBF4BQ8NFT6 615 aa28.18■■■□□ 2.1
CDKN3-211ENST00000611205 SUGCTQ9HAC7 445 aa28.18■■■□□ 2.1
CDKN3-211ENST00000611205 RTEL1Q9NZ71 1219 aa28.18■■■□□ 2.1
CDKN3-211ENST00000611205 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa28.18■■■□□ 2.1
CDKN3-211ENST00000611205 ERVK-21P61565 698 aa28.17■■■□□ 2.1
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CDKN3-211ENST00000611205 LMCD1Q9NZU5 365 aa28.17■■■□□ 2.1
CDKN3-211ENST00000611205 TREHO43280 583 aa28.16■■■□□ 2.1
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CDKN3-211ENST00000611205 NEDD9Q14511 834 aa28.16■■■□□ 2.1
CDKN3-211ENST00000611205 CYFIP1Q7L576 1253 aa28.16■■■□□ 2.1
CDKN3-211ENST00000611205 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa28.16■■■□□ 2.1
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CDKN3-211ENST00000611205 FRMPD4Q14CM0 1322 aa28.16■■■□□ 2.1
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CDKN3-211ENST00000611205 CTSHP09668 335 aa28.15■■■□□ 2.1
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CDKN3-211ENST00000611205 USP26Q9BXU7 913 aa28.15■■■□□ 2.1
CDKN3-211ENST00000611205 INSL6Q9Y581 213 aa28.15■■■□□ 2.1
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CDKN3-211ENST00000611205 METTL7BQ6UX53 244 aa28.14■■■□□ 2.1
CDKN3-211ENST00000611205 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
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CDKN3-211ENST00000611205 MYL10Q9BUA6 226 aa28.14■■■□□ 2.1
CDKN3-211ENST00000611205 NLRC5Q86WI3 1866 aa28.14■■■□□ 2.1
CDKN3-211ENST00000611205 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa28.13■■■□□ 2.09
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CDKN3-211ENST00000611205 SP4Q02446 784 aa28.13■■■□□ 2.09
CDKN3-211ENST00000611205 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa28.13■■■□□ 2.09
CDKN3-211ENST00000611205 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
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CDKN3-211ENST00000611205 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
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CDKN3-211ENST00000611205 SETD4Q9NVD3 440 aa28.13■■■□□ 2.09
CDKN3-211ENST00000611205 BDP1A6H8Y1 2624 aa28.13■■■□□ 2.09
CDKN3-211ENST00000611205 XIRP2A4UGR9 3374 aa28.12■■■□□ 2.09
CDKN3-211ENST00000611205 BRWD1Q9NSI6 2320 aa28.12■■■□□ 2.09
CDKN3-211ENST00000611205 USP17L6PQ6QN14 398 aa28.12■■■□□ 2.09
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CDKN3-211ENST00000611205 SEPT8Q92599 483 aa28.12■■■□□ 2.09
CDKN3-211ENST00000611205 C17orf80Q9BSJ5 609 aa28.12■■■□□ 2.09
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CDKN3-211ENST00000611205 SPZ1Q9BXG8 430 aa28.11■■■□□ 2.09
CDKN3-211ENST00000611205 LY9Q9HBG7 655 aa28.11■■■□□ 2.09
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CDKN3-211ENST00000611205 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa28.1■■■□□ 2.09
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CDKN3-211ENST00000611205 MAP3K14Q99558 947 aa28.09■■■□□ 2.09
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CDKN3-211ENST00000611205 PRC1O43663 620 aa28.07■■■□□ 2.08
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CDKN3-211ENST00000611205 TOP1MTQ969P6 601 aa28.06■■■□□ 2.08
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CDKN3-211ENST00000611205 EPHX3Q9H6B9 360 aa28.06■■■□□ 2.08
CDKN3-211ENST00000611205 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
CDKN3-211ENST00000611205 RXRAP19793 462 aa28.05■■■□□ 2.08
CDKN3-211ENST00000611205 SMARCA1P28370 1054 aa28.05■■■□□ 2.08
CDKN3-211ENST00000611205 GNAQP50148 359 aa28.05■■■□□ 2.08
CDKN3-211ENST00000611205 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
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