RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591652.1

ZNF559-209, Transcript of zinc finger protein 559, human

TSL 3

Gene ZNF559, Length 692 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF559-209	ENST00000591652	MSC	O60682	206 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ZNF559-209	ENST00000591652	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ZNF559-209	ENST00000591652	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ZNF559-209	ENST00000591652	PROSER1	Q86XN7	944 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ZNF559-209	ENST00000591652	IER2	Q9BTL4	223 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ZNF559-209	ENST00000591652	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ZNF559-209	ENST00000591652	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ZNF559-209	ENST00000591652	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	DLX3	O60479	287 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	ICAM4	Q14773	271 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	SLC27A2	O14975	620 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	GPR42	O15529	346 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	COL6A1	P12109	1028 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	TCF3	P15923	654 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	EPHB4	P54760	987 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	PPP2CB	P62714	309 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	PPP2CA	P67775	309 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	ARID5A	Q03989	594 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	NFATC3	Q12968	1075 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	CDSN	Q15517	529 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	TINF2	Q9BSI4	451 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	ST7	Q9NRC1	585 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	USP53	Q70EK8	1073 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	DTX3	Q8N9I9	347 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	DNER	Q8NFT8	737 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	CD248	Q9HCU0	757 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	B4GALT4	O60513	344 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	GRIN1	Q05586	938 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	DDR2	Q16832	855 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	VASN	Q6EMK4	673 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	NUDT11	Q96G61	164 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	SGSM3	Q96HU1	749 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	KLC2	Q9H0B6	622 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	DLL4	Q9NR61	685 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	KLHL18	O94889	574 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	FAH	P16930	419 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	TUSC3	Q13454	348 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	PHF19	Q5T6S3	580 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	SLFN13	Q68D06	897 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	LBX2	Q6XYB7	198 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	SPRED1	Q7Z699	444 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	DCAF4	Q8WV16	495 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	PTPN18	Q99952	460 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	JADE2	Q9NQC1	790 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	PRODH	O43272	600 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	LTF	P02788	710 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	CHGB	P05060	677 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	CKM	P06732	381 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	FGFR1	P11362	822 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	COL6A2	P12110	1019 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	GRK2	P25098	689 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	GRK3	P35626	688 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	NTRK3	Q16288	839 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	PATE3	B3GLJ2	98 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	5.9	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	KLF4	O43474	513 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ZNF559-209	ENST00000591652	KNG1	P01042	644 aa		5.9	□□□□□ -1.46

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